Uvedba metode za ugotavljanje odpornosti bakterije Chlamydia trachomatis proti makrolidomMarušić, Monika (Avtor) Keše, Darja (Mentor) klamidijeChlamydia trachomatisspolno prenosljive okužbeprotimikrobna odpornostmakrolidi23S rRNKmutacijeChlamydia trachomatis je najpogostejša bakterijska povzročiteljica spolno prenosljivih okužb v svetovnem merilu. Večinoma okužbe potekajo asimptomatsko, ki v odsotnosti zdravljenja vodijo v resne zdravstvene zaplete. Za zdravljenje klamidijske okužbe se priporoča azitromicin ali doksiciklin. Oba antibiotika spadata v skupino bakteriostatičnih antibiotikov, ki z vezavo na 23S rRNK in 16S rRNK blokirajo sintezo beljakovin. Stopnje neuspešnega zdravljenja so dokaj visoke (8–23 %), najpogostejša vzroka sta ponovna okužba po prekinitvi zdravljenja ali razvoj heterotipske odpornosti. Odpornost proti makrolidom je lahko posledica mutacij v genu za 23S rRNK, ki ovirajo vezavo in interakcijo antibiotika s tarčnim mestom delovanja. Za ugotavljanje občutljivosti klamidije za antibiotike in določanje minimalne inhibitorne koncentracije (MIK) se najpogosteje uporablja metoda gojenja v celični kulturi ob prisotnosti antibiotika v različnih koncentracijah, vendar se test zaradi zahtevnosti izvedbe in manjše občutljivosti uporablja le izjemoma. Namen magistrske naloge je vzpostavitev učinkovite metode za preverjanje prisotnosti mutacij v domeni V 23S rRNK, ki posredujejo odpornost proti makrolidom. V raziskavo smo vključili 58 vzorcev DNK kliničnih izolatov z večkrat potrjeno okužbo s C. trachomatis, kljub antibiotični terapiji. 36 vzorcev DNK smo uspešno pomnožili z alelno specifičnimi oligonukleotidi in izvedli sekvenciranje. Na podlagi bioinformacijske analize na pozicijah A2057, A2058, A2059 in T2611 (štetje po E. coli) nismo našli mutacij, ki vodijo v razvoj odpornosti proti makrolidom. V skladu s pričakovanji smo uspešno uvedli molekularno metodo, ki nam omogoča dokazovanje mutacij, ki posredujejo odpornost proti makrolidom.[M. Marušić]20212021-12-23 12:15:11Magistrsko delo/naloga134071UDK: 579.61:616.98:579.882:577.2.08VisID: 203077COBISS_ID: 91211267sl