Raziskave strukturnih in termodinamskih lastnosti mešanic nabitih koloidov z nevtralnimi polimeri z računalniškimi simulacijami Monte CarloBercko, Urška (Avtor) Reščič, Jurij (Mentor) privlačna interakcijasimulacija Monte Carloproteinpolimerizključeni volumenradij sukanjaS kanoničnimi simulacijami Monte Carlo so bili v tej diplomski nalogi raziskani vplivi privlačnih interakcij med nabitimi proteinskimi molekulami na porazdelitev proteinov. Modelna raztopina je vsebovala nabite koloide, protiione in nevtralne polimere polietilen glikola, ki so bili v raztopini prisotni bodisi kot molekule bodisi kot teoretični privlačni potencial Asakura-Oosawa. Narejena je bila primerjava rezultatov simulacije modela mešanice proteinov in eksplicitnih verig z rezultati simulacije modela, kjer je namesto eksplicitnih verig med proteini deloval teoretični Asakura-Oosawa (AO) potencial. Ugotovljeno je bilo, da AO teorija bistveno premalo upošteva vpliv izključenega volumna monomerov na porazdelitev proteinov, kar je glavni razlog za razkorak med obema modeloma. Podan je bil predlog rešitve tega problema v smislu upoštevanja izključenega volumna monomernih enot preko povečevanja radija sukanja. Ugotovljeno je bilo, da radij sukanja ne nadomesti končne velikosti monomernih enot. Raziskani so bili tudi vplivi koncentracije polimernih verig, radija sukanja, izključenega volumna ter naboja proteinov na porazdelitev protein-protein. Učinkovitost polimerov za destabilizacijo modelne raztopine je bila merjena z radialno porazdelitveno funkcijo protein-protein. Verjetnost destabilizacije modelne raztopine se je povečevala z večanjem koncentracije in radija sukanja polimernih verig.20212021-11-24 11:55:00Diplomsko delo/naloga133373VisID: 19301COBISS_ID: 89693955sl