Vloga hnRNPK in RBM4 v izražanju izbranih mRNA in circRNAŠumah, Anže (Avtor) Režen, Tadeja (Mentor) hnRNPKRBM4krožna RNArak jeterhepatocelularni karcinomKrožne ribonukleinske kisline (circRNA) so skupina endogenskih ribonukleinskih kislin z enoverižno kovalentno zaprto strukturo. Z razvojem visokozmogljivih tehnologij določevanja zaporedja RNA in bioinformatskih orodij so ugotovili, da so zelo številčne, raznolike in ohranjene med vrstami, njihovi vzorci izražanja pa so specifični v različnih vrstah celic in tkiv kot tudi v različnih fazah razvoja. Odkrili so, da imajo raznolike molekularne funkcije, ki se odražajo v številnih fizioloških procesih (tako na celični kot na sistemski ravni) in posledično tudi v patoloških procesih. Čedalje več raziskav ugotavlja, da so nekatere krožne RNA povezane z razvojem hepatocelularnega karcinoma (HCC), ki je najpogostejša oblika raka jeter. Spremenjena raven izražanja krožnih RNA v HCC ni le posledica sprememb v celicah oziroma tkivu (zaradi česar imajo krožne RNA velik potencial kot diagnostični biološki označevalci), ampak imajo krožne RNA tudi same pomembno vlogo pri razvoju patološkega stanja preko vpliva na različne procese, kot so celični cikel, angiogeneza, apoptoza, metabolizem in epitelijsko-mezenhimski prehod. Preučevali smo vlogo heterogenega jedrnega ribonukleoproteina K (hnRNPK) in RNA-vezavnega proteina 4 (RBM4) pri uravnavanju izražanja izbranih krožnih RNA. Proteina hnRNPK in RBM4 imata pomembno vlogo pri procesiranju prekurzorske RNA. Za hnRNPK so pokazali, da se pri HCC čezmerno izraža, za RBM4 pa so ugotovili, da višja raven izražanja pri pacientih s HCC pozitivno korelira z večjimi možnostmi preživetja. Tekom diplomskega dela smo pripravili vektor za čezmerno izražanje proteina RBM4 v sesalskem sistemu. Ta vektor in vektor za čezmerno izražanje proteina hnRNPK smo s pomočjo transfekcije vnesli v celične kulture modelne celične linije za HCC Huh-7 in s prenosom western in imunodetekcijo dokazali čezmerno izražanje obeh proteinov. Z metodo kvantitativne verižne reakcije s polimerazo smo merili raven izražanja izbranih mRNA in circRNA v celičnih kulturah. Naši rezultati nakazujejo možnost, da čezmerno izražanje proteina hnRNPK vpliva na povišanje ravni izražanja krožnih RNA hsa_circ_0040921 in hsa_circ_0062682, čezmerno izražanje proteina RBM4 pa vpliva na povišano raven izražanja krožnih RNA hsa_circ_0048492 in hsa_circ_0028196. Za statistično značilnost rezultatov je bilo število ponovitev prenizko.20212021-09-17 12:20:00Diplomsko delo/naloga130812VisID: 11862COBISS_ID: 85623043sl