Molekulsko kloniranje in filogenetske analize nekodirajočih vtRNANograšek, Tim (Avtor) Župunski, Vera (Mentor) vtRNAfilogenetska analizakloniranje IVA˝Vault˝ RNA (vtRNA) je krajše, nekodirajoče zaporedje RNA, ki ga najdemo v kompleksih ˝vault˝, znotraj citoplazme evkariontskih celic. Sama vloga vtRNA zaenkrat še ni točno določena, prav tako ne vloga celotnega kompleksa. Ker se pogosto nahajajo v celicah, ki so v različnih bolezenskih stanjih, pa jih v zadnjem času vedno bolj raziskujejo. Pri človeku so bila identificirana štiri različna zaporedja vtRNA in sicer vtRNA1-1, vtRNA1-2, vtRNA1-3 in vtRNA2-1. Slednji se nahaja na drugem lokusu petega kromosoma kot ostali trije. Poleg teh štirih zaporedij sta v človeškem genomu prisotna dva psevdogena, poimenovana vtRNA2-2 in vtRNA3-1. Ta dva se nahajata na drugih kromosomih kot ostali štirje. V okviru diplomske naloge smo naredili filogenetsko analizo zaporedij vtRNA pri vretenčarjih. Ugotovili smo, da se razvoj različnih vrst vtRNA delno ujema s splošnim taksonomskim razvojem, hkrati pa je prisotnih tudi nekaj odstopanj. Pri nekaterih odstopanjih smo z podrobnim pregledom poravnav zaporedij pokazali njihov razlog. Največja ujemanja zaporedij vtRNA so bila na regulacijskih mestih, kjer so se ta skozi evolucijo najbolj ohranila. Pri laboratorijskem delu pa smo pripravili vektorje z različnimi človeškimi zaporedji vtRNA, da bi lahko izražali v sesalskih celicah. Na ta način bomo lahko določili njihove interakcijske partnerje in lokacijo v celici.20212021-09-10 08:25:06Diplomsko delo/naloga130006VisID: 16921COBISS_ID: 82872579sl