Bioinformacijska analiza parov toksin-antitoksin cianobakterije Microcystis aeruginosa PCC 7806 in molekulsko kloniranje antitoksinov Bh695_0426 in Bh695_0430Glavič, Kim (Avtor) Dolinar, Marko (Mentor) cianobakterijeMicrocystis aeruginosa PCC 7806sistemi toksin-antitoksinantitoksinSistemi toksin-antitoksin (TA) so genetski elementi, ki zapisujejo za relativno stabilen proteinski toksin, ki onemogoči rast celice, in nestabilen antitoksin, ki zavre škodljivi učinek kompatibilnega toksina. Njihova biološka vloga še ni povsem razumljena, znano pa je, da sodelujejo pri mnogih bioloških procesih, izmed katerih izstopajo postsegregacijska smrt, abortivna infekcija in bakterijska persistenca. Najdemo jih na številnih plazmidih in kromosomih mnogih arhej ter bakterij, med katere sodi tudi cianobakterija Microcystis aeruginosa PCC 7806. Kljub številčnosti sistemov TA v genomu te cianobakterije jih je bilo do sedaj le nekaj tudi eksperimentalno ovrednotenih, zato smo v sklopu tega diplomskega dela želeli zapisa za dva antitoksina izraziti in izolirati iz celic Escherichia coli. Z bioinformacijskimi orodji smo zbrali in analizirali predvidene pare TA ter izmed teh izbrali dva, katerih zapisa za antitoksina smo pomnožili. Z metodami molekulskega kloniranja smo gena za antitoksina Bh695_0426 in Bh695_0430 vstavili v klonirni vektor pJET1.2/blunt. Prenos v ekspresijski vektor pET-28b(+) ni bil uspešen. Uspešno izražanje genov za antitoksina in izolacija proteinskih produktov bi omogočila nadaljnje raziskave njihove strukture in funkcije, pa tudi regulacije izražanja TA. Zaradi tega bi bilo smiselno eksperimentalno delo z manjšimi spremembami ponoviti.20212021-09-08 14:40:05Diplomsko delo/naloga129828VisID: 15862COBISS_ID: 80181251sl