Sekvenciranje slovenskih genomov virusa SARS-CoV-2 za ugotavljanje interakcij med proteini virusa in človekaBrvar, Matic (Avtor) Petrovič, Uroš (Mentor) Korva, Miša (Komentor) KoronavirusiSARS-CoV-2COVID-19NGSevolucija virusaproteinske interakcijeDecembra 2019 je prišlo do izbruha atipične pljučnice na Kitajskem v mestu Vuhan. Analiza genomskega zaporedja je pokazala, da gre za novega predstavnika koronavirusov – virus SARS-CoV-2, sorodnika že znanima povzročiteljema epidemije SARS-CoV in MERS-CoV. Za učinkovito sledenje napredovanja pandemije je ključnega pomena razvoj tehnologije sekvenciranja naslednje generacije. NGS je močno orodje, ki omogoča sprotno ugotavljanje evolucije virusa SARS-CoV-2, ki se dogaja na ravni mutacij genoma. Mutacije se dogajajo spontano pri replikacijskem ciklu virusa in večina se jih ne obdrži v populaciji. Določene mutacije pa se odražajo v povišanem fitnesu virusa in predstavljajo evolucijsko prednost. V raziskavi smo analizirali evolucijo virusa v populaciji Slovenije od 4.3.2020 do 14.6.2021, pri čemur smo uporabili 16.235 virusnih zaporedij, in evolucijo virusa v dveh imunsko oslabljenih osebah. Natančneje smo opisali funkcijo proteina ORF8, ki je potencialna tarča delovanja zdravil. Namesto neposrednega ciljanja virusnega proteina ORF8, bi lahko posredno vplivali na gostiteljeve interaktorje ORF8.20212021-09-08 07:15:04Magistrsko delo/naloga129766VisID: 195432COBISS_ID: 75985667sl