Vpliv mutacij v genih c-KIT, PDGFRA, KRAS, NRAS IN BRAF na potek bolezni pri slovenskih bolnikih z razsejanimi gastrointestinalnimi stromalnimi tumorjiBombač, Alenka (Avtor) Zakotnik, Branko (Mentor) Novaković, Srdjan (Komentor) gastrointestinalni stromalni tumor (GIST)mutacijec-KITPDGFRAKIT/PDGFRA divji tip GISTimatinibPri približno 85% bolnikov je glavni vzrok za razvoj GIST aktivacijska mutacija (patogena/verjetno patogena različica – PR/VPR, mutacija – PR/VPR) v enem izmed genov c-KIT ali PDGFRA, medtem-ko pri 10-15% bolnikov z GIST omenjena gena nista mutirana (KIT/PDGFRA divji tip GIST). Pri njih se aktivacijske mutacije – PR/VPR lahko pojavijo v genih, ki kodirajo mitohondrijski encimski kompleks sukcinat dehidrogenazo, redkeje pa v genih KRAS, NRAS ali BRAF. Poznavanje mutacijskega statusa vseh naštetih genov, ki so vključeni v patogenezo GIST, je izredno pomembno pri načrtovanju zdravljenja bolnikov z GIST z zaviralci tirozinskih kinaz (TKI), saj je klinični učinek imatiniba, odvisen od genotipa tumorja. Na Oddelku za molekularno diagnostiko Onkološkega inštituta Ljubljana smo v sklopu doktorske raziskave izvedli molekularno karakterizacijo primarnih tumorjeva bolnikov z razsejanimi GIST. V raziskavo smo vključili bolnike, ki so bili po podatkih iz Registra raka RS, med januarjem 2002 in decembrom 2011 zdravljeni s TKI na Onkološkem inštitutu Ljubljana. Vsem bolnikom iz naše raziskave smo z metodo direktnega sekvenciranja po Sangerju določili frekvence, mesta in vrste mutacij – PR/VPR v genu c-KIT (eksoni 9, 11, 13, in 17) in v genu PDGFRA (eksoni 12, 14 in 18). Pri bolnikih z določenim KIT/PDGFRA divjim tipom GIST pa smo z metodo kvantitativnega PCR določili tudi najpogostejše (»hot spot«) mutacije – PR/VPR v genih KRAS, NRAS, BRAF, PIK3CA in AKT1 ter imunohistokemično izražanje SDH kompleksa. Nadalje smo ugotavljali tudi vpliv mesta in vrste dokazanih mutacij – PR/VPR na izhod zdravljenja (mediani čas brez napredovanja bolezni in mediani čas celokupnega preživetja) naših bolnikov z imatinibom. Z doktorsko raziskavo smo ugotovili, da se frekvence mutacij – PR/VPR v preiskovanih genih pri naših bolnikih ujemajo s podatki iz literature. Skupno smo v naši raziskavi dokazali 49 različnih mutacij – PR/VPR v genih c-KIT in PDGFRA. V genu c-KIT smo odkrili 8 novih, v literaturi še nikoli opisanih mutacij – VPR; pri enem bolniku pa smo v genu PDGFRA odkrili dve primarni mutaciji – PR/VPR v eksonu 14, kar je v literaturi izjemno redko opisano. V skupini bolnikov s KIT/PDGFRA divjim tipom GIST mutacij – PR/VPR v genih KRAS, NRAS, BRAF, PIK3CA in AKT1 nismo dokazali pri nobenem bolniku, SDH kompleksa pa nista izražala dva od teh bolnikov. Pri ugotavljanju vpliva mesta in vrste dokazanih mutacij – PR/VPR na izhod zdravljenja pa smo ugotovili, da mesto mutacije – PR/VPR v eksonu 11 gena c-KIT klinično pomembno napoveduje ugoden potek zdravljenja z imatinibom tudi pri slovenskih bolnikih z razsejanim GIST ter da vrsta mutacije – PR/VPR ni pomembna za izhod njihovega zdravljenja. Z doktorsko raziskavo potrjujemo, da je molekularna analiza tumorjev bolnikov z GIST nujna in predstavlja pomembno diagnostično orodje pri načrtovanju zdravljenja teh bolnikov z zaviralci tirozinskih kinaz.20202020-12-25 07:15:04Doktorsko delo/naloga124079VisID: 16305COBISS_ID: 45897731sl