Izražanje izbranih nekodirajočih RNA pri bolnikih z amiotrofično lateralno sklerozoDolinar, Ana (Avtor) Ravnik Glavač, Metka (Mentor) nevrodegenerativne bolezniamiotrofična lateralna sklerozaepigenetikanekodirajoče RNAcircRNAmiRNAmetilacijaAmiotrofična lateralna skleroza (ALS) je nevrodegenerativna bolezen, ki prizadene zgornje in spodnje motorične nevrone. Pri slabih 30 % bolnikov najdemo mutacije v enem izmed 33 bolezenskih genov, nastanek bolezni pri ostalih bolnikih pa je verjetno povezan s kombinacijo različnih epigenetskih dejavnikov. V okviru doktorske disertacije smo preučevali izražanje krožnih RNA (circRNA), mikro RNA (miRNA), njihovih gostiteljskih genov in metilacijo DNA v promotorskih regijah intergenskih miRNA. Z uporabo mikromrež in kasnejšim potrjevanjem teh rezultatov smo odkrili šest zvišano izraženih (hsa_circ_0000567, hsa_circ_0005218, hsa_circ_0035796, hsa_circ_0043138, hsa_circ_0063411 in hsa_circ_0088036) ter eno znižano izraženo (hsa_circ_0023919) circRNA v levkocitih bolnikov z ALS. Hsa_circ_0023919, hsa_circ_0063411 in hsa_circ_0088036 so se izkazale kot najbolj obetavni biološki označevalci. V izražanju treh gostiteljskih genov, PICALM (hsa_circ_0023919), SUSD1 (hsa_circ_0088036) in AATK (miR-657), ni bilo razlik med bolniki in zdravimi kontrolami, TNRC6B (hsa_circ_0063411) pa je bil pri bolnikih zvišano izražen. Metilacija preučevanih mest CpG v promotorskih regijah intergenskih miRNA miR-182, miR-217 in miR-451a ne vpliva na njihovo izražanje. MiR-182 in miR-451a sta bili pri bolnikih zvišano izraženi, stopnje izražanja miR-217 in miR-657 pa zaradi nespecifičnih pomnožkov nismo mogli določiti. Izražanje circRNA je večinoma šibko ali zmerno negativno povezano z različnimi kliničnimi značilnostmi bolnikov ter zmerno do močno pozitivno povezano z izražanjem drugih circRNA. Opazili smo šibko negativno povezavo med izražanjem miR-182 in izražanjem njenega predpostavljenega tarčnega gena TNRC6B, med izražanjem miRNA in njihovih predpostavljenih tarčnih circRNA pa nismo opazili povezav.20202020-11-11 10:07:12Doktorsko delo/naloga121950VisID: 16266COBISS_ID: 36968195sl