Grobozrnati modeli lipidnih membran in njihova uporabaKoradin, Veronika (Avtor) Reščič, Jurij (Mentor) molekulsko modeliranjegrobozrnati modelilipidne membraneMolsimDiplomsko delo zajema predstavitev molekulskega modeliranja. Poznamo pet nivojev modeliranja, ki se razlikujejo po časovni lestvici, velikosti sistema in namenu uporabe. Predstavljeni so različni grobozrnati modeli, ki so jih uporabljali v izbranih raziskavah lipidnih membran. Tak model tvorimo tako, da več atomov združimo v en psevdo atom. Primeri različnih psevdo atomov so metilna skupina, benzenov obroč, aminokislinski ostanki. S pomočjo simulacij na opisanih modelih lipidnih membran so izračunane različne lastnosti, kot so debelina dvosloja, upogibni modul, modul stisljivosti območja, linearna in površinska napetost, konstanta bočne difuzije, hitrost prepustnosti vode po dvosloju, flip-flop hitrost idr. Na koncu pa je predstavljen del rezultatov, do katerih sem prišla z računalniško simulacijo v programu Molsim.20202020-09-09 16:45:00Diplomsko delo/naloga119540VisID: 9341COBISS_ID: 29599235sl