Identifikacija borelij lymske borelioze z metodo MALDI-TOFHonsić, Ivana (Avtor) Ružić Sabljić, Eva (Mentor) Cerar Kišek, Tjaša (Komentor) Borrelia burgdorferi sensu latolymska boreliozaidentifikacijamolekularne metodeMluI-LRFPMALDI-TOFMed glavne povzročiteljice endemske zoonoze v Sloveniji, lymske borelioze sodijo borelije znotraj kompleksa Borrelia burgdorferi sensu lato. Eno glavnih identifikacijskih metod borelij predstavlja metoda polimorfizma dolžin restrikcijskih fragmentov (MluI-LRFP), ki odlično tipizira borelije do nivoja vrst in podvrst, v ospredje identifikacijskih metod patogenov pa prihaja tudi metoda ionizacije v matriksu z desorpcijo z laserjem in masnim analizatorjem časa preleta ionov (MALDI-TOF). V magistrski nalogi, nas je zanimalo ali lahko tako z metodo MluI-LRFP kot z metodo MALDI-TOF uspešno identificiramo borelije lymske borelioze do nivoja vrste. Z metodo MluI-LRFP smo 93 borelijskih izolatov uspešno opredelili do nivoja vrste in za njih specifičnih podvrst, od katerih je 63,4 % izolatov predstavljajo Borrelia afzelii Mla1, 31,2 % Borrelia garinii Mlg2, 1,05 % Borrelia garinii Mlg4 in 1,05 % Borrelia garinii Mlg1 ter 2,1 % izolatov Borrelia burgdorferi sensu stricto Mlb2 in 1,05 % Borrelia burgdorferi sensu stricto Mlg8. Z metodo MALDI-TOF smo do nivoja vrste uspešno opredelili 90,3 % izolatov, katere smo predhodno tipizirali z metodo MluI-LRFP, 9,7 % izolatov pa smo identificirali le do rodu oz. jim nismo uspeli določiti nobenega identifikacijskega nivoja. Dognali smo, da lahko z obema metodama uspešno identificiramo borelije lymske borelioze do nivoja vrste, ob čemer MluI-LRFP metoda ostaja boljša izbira za razlikovanje znotraj vrst. Metodi smo primerjali in ovrednotili.[I. Honsić]20202020-09-05 07:15:08Magistrsko delo/naloga119217UDK: 579.62:616.993-078VisID: 179187COBISS_ID: 32524291sl