Določanje novih povezav gen-bolezen-zdravilo z analizo zbirke CanceromeDjurica Potpara, Veronika (Avtor) Kunej, Tanja (Mentor) genomikasladkorna bolezenrakpridružene bolezniprerazporejanje zdravilpodatkovna zbirkaOsebe s sladkorno boleznijo tipa 1 (DM1) in sladkorno boleznijo tipa 2 (DM2) pogosteje obolijo za boleznimi raka, vendar pa je vpliv genskih dejavnikov na sopojavnost bolezni v veliki meri še neraziskan. Naš cilj je bil ustvariti celovito zbirko vseh genov in SNP-jev povezanih z rakom in DM in določiti molekularne povezave med boleznima. Pripravili smo zbirko Cancerome (zbranih 3685 genov, 5613 SNP-jev) in zbirko genov in SNP-jev povezanih z DM1 (260 genov in 531 SNP-jev) in DM2 (3572 genov in 1965 SNP-jev). Preučevali smo vpliv SNP-jev, SNP-jev s škodljivim učinkom na genski produkt (pSNP-jev), genov in metabolnih poti povezanih z boleznimi raka in DM na sopojavnost bolezni. Preučevali smo tudi vpliv razdalje (< 1 Mb) med geni povezanimi z rakom in DM na sopojavnost bolezni. Kot negativno kontrolo povezanosti med rakom in DM smo uporabili zbirko SNP-jev in genov povezanih z nevroblastomom, saj ta rak v epidemioloških študijah ni kazal povezanosti z DM. Pokazali smo, da lahko na podlagi števila pSNP-jev, genov s spremenjeno funkcionalnostjo (GSF-jev) in analize SNP-jev povezanih z rakom in DM v istih genih sklepamo o povezanosti bolezni. Kot negativno kontrolo sopojavnosti smo uporabili zbirko genov in SNP-jev povezanih z rakom prostate, saj imajo osebe s tem tipom raka manjše tveganje za razvoj DM. Na podlagi kvantitativne analize molekularnih povezav nismo mogli sklepati o sopojavnosti med rakom in DM, a predvidevamo, da bi z natančnejšo analizo alelov povezanih s tipi raka in DM uspeli oceniti tveganje za sopojavnost. Izvedli smo prerazporejanje zdravil in odkrili nove povezave zdravilo-gen-bolezen pri vseh tipih raka in DM. Ta študija je osnova za določanje zanesljivejših biooznačevalcev bolezni raka in DM ter iskanje biooznačevalcev, s katerimi bomo lahko ocenili tveganje za razvoj sopojavnih bolezni.[V. Djurica Potpara]20202020-08-29 07:16:44Magistrsko delo/naloga118641UDK: 575.112:601.4:577.21:606:616-006.6:616.379(043.2)VisID: 178606COBISS_ID: 26827779sl