Odziv imunskega sistema na izbrane seve bakterije Escherichia coli in vpliv na cirkadiano uroŽužek, Zala (Avtor) Starčič Erjavec, Marjanca (Mentor) Kovač, Urša (Komentor) cirkadiana uracirkadiani ritemcirkadiani geničrevesna mikrobiotaEscherichia colivirulentni dejavnikiimunski sistemcitokiniOsrednja cirkadiana ura, locirana v možganih, sinhronizira periferne cirkadiane ure v organih, tkivih in celicah ter z vplivom na mnogo metabolnih, fizioloških in vedenjskih procesov organizmu pomaga ohranjati homeostazo. Pri vzpostavljanju homeostaze gostitelja ima pomembno vlogo tudi črevesna mikrobiota. Dobro poznan je vpliv mikrobiote na imunski sistem, nedavne raziskave pa disbiozo povezujejo tudi z motnjami cirkadiane ure gostitelja. V magistrski nalogi smo se osredotočili na pomembnega predstavnika mikrobiote, bakterijo Escherichia coli (E. coli), in preiskovali njen vpliv na evkariontsko cirkadiano uro in imunski sistem v vzpostavljeni stabilni kokulturi s človeško jetrno celično linijo HepG2. Za poskuse smo iz zbirke sevov E. coli, pridobljenih iz vzorcev blata zdravih posameznikov, izbrali dva predstavnika te bakterijske vrste, sev BJ23 s številnimi, in sev BJ17 z le nekaj zapisi za z virulenco povezane dejavnike. Po 4 urni inkubaciji seva BJ v kokulturi s celično linijo HepG2 smo izpostavljene celice HepG2 vzorčili 72 ur in analizirali količino relativne mRNA cirkadianih ter imunskih genov z metodo qPCR. Ugotovili smo, da bakterijski sev BJ23 po 72-ih urah močneje vpliva na gene cirkadiane ure celic HepG2, medtem ko pri aktivaciji genov imunskega sistema zaradi nizkega izražanja mRNA testiranih imunskih genov med sevoma ni bilo opaznih razlik. Naša raziskava je tako pripomogla k boljšemu razumevanju vpliva bakterije E. coli na cirkadiano uro gostitelja.[Z. Žužek]20202020-08-19 07:15:09Magistrsko delo/naloga118082UDK: 577.21:616-097VisID: 177379COBISS_ID: 25660931sl