Klasifikacija virusnih in bakterijskih genomov s konvolucijskimi nevronskimi mrežamiAlič, Anže (Avtor) Curk, Tomaž (Mentor) CNNbioinformatikaklasifikacija virusov in bakterijgenomski pripisiV diplomski nalogi smo razvili nevronsko mrežo za napovedovanje uvrstitve v taksonomijo organizma na podlagi kratkih izsekov genoma, ki jih pridobimo s sekvenciranjem. Ovrednotili smo uporabo dodatnih opisov genoma in uporabo dodatnih relacij med ciljnimi razredi. Za reševanje problema in gradnjo napovednih modelov smo uporabili globoke konvolucijske nevronske mreže. Predlagano metodo smo preizkusili na referenčnih genomih virusov in bakterij. Eksperimentalni rezultati pokažejo, da smo zastavljen problem rešili uspešno, saj smo, v najboljšem primeru, dosegli ROC AUC 0.92. Dodatni opisi genoma ne izboljšajo uspešnosti napovednega modela. Uporaba dodatnih relacij v obliki taksonomije zelo izboljša napovedni model, saj nevronska mreža, kljub manjšemu številu učnih podatkov, uspešno generalizira zastavljen problem.20202020-02-28 10:35:02Diplomsko delo/naloga114438VisID: 23547COBISS_ID: 1538544067sl