Preureditve gena CRLF2 pri Philadelphia-podobni akutni limfoblastni levkemijiČrepinšek, Klementina (Avtor) Podgornik, Helena (Mentor) Škerget, Matevž (Komentor) gen CRLF2Philadelphia-podobna akutna limfoblastna levkemijapreureditve gena CRLF2fluorescenčna in situ hibridizacijacitogenetske spremembePhiladelphia-podobna akutna limfoblastna levkemija (Ph-podobna ALL) je oblika B-celične ALL, ki ima zelo podoben profil izraženih genov kot Ph-pozitivna ALL, vendar pa nima prisotnega značilnega kromosoma Ph. Na genski ravni gre za zelo heterogeno bolezen, pri kateri lahko pride do različnih sprememb, ki vodijo v deregulacijo citokinskih receptorjev in tirozinskih kinaz. Posledično predstavlja diagnostika te bolezni precejšen izziv in zahteva sistematičen večstopenjski pristop ter uporabo različnih metod. Najpogostejše genske spremembe pri tej obliki ALL so spremembe v genu CRLF2. Gen CRLF2 se nahaja v psevdoavtosomni regiji 1 na kratki ročici spolnih kromosomov in kodira citokinski receptor tipa I, ki je del receptorja za timusni stromalni limfopoetin. Aktivacija tega receptorja aktivira signalne poti, ki so vpletene v procese proliferacije in razvoja hematopoetskega sistema. Spremembe gena CRLF2 vodijo do nenadzorovane proliferacije in preživetja prekurzorskih celic B. Namen magistrske naloge je bil ugotoviti, kakšna je pogostost preureditev gena CRLF2 pri slovenskih bolnikih z B-ALL in ovrednotiti uporabnost preiskave FISH v odkrivanju bolnikov s Ph-podobno ALL. Preureditve gena CRLF2 na kratki ročici spolnih kromosomov smo zaznavali z dvobarvno razcepno fluorescenčno DNA-sondo Cytocell CRLF2 Breakapart Probe. Najprej smo določili pražni vrednosti za DNA-sondo, in sicer 3,8 % za translokacijo (največkrat nastane IGH-CRLF2) in za delecijo (nastane P2RY8-CRLF2) prav tako 3,8 %. Analizirali smo 49 vzorcev, pridobljenih iz kostnega mozga slovenskih bolnikov z B-ALL, ki niso imeli prisotnih drugih ponavljajočih se genskih nepravilnosti. Preureditve gena CRLF2 smo našli pri 4 preiskovancih, kar predstavlja 8,2 % (4/49) analiziranih vzorcev oz. 3 % (4/133) vseh slovenskih bolnikov z B-ALL med januarjem 2012 in junijem 2019. Pri 3 preiskovancih je bila prisotna translokacija, pri 1 pa delecija. Pri 1 preiskovancu s translokacijo smo določili tudi rahlo povišano izražanje proteina TSLPR (določeno s pretočno citometrijo). Preiskava FISH se je izkazala za uspešno pri odkrivanju bolnikov s Ph-podobno ALL, njena vpeljava v rutino pa je enostavna. Predlagamo preverjanje prisotnosti preureditev gena CRLF2 s kombinacijo pretočne citometrije in preiskave FISH ter uvedbo DNA-sonde CRLF2 v algoritem izbire DNA-sond pri bolnikih z B-ALL, pri čemer se bo preiskava s sondo CRLF2 izvedla, če bodo predhodno izključene vse druge ponavljajoče se genske spremembe.20202020-02-26 08:35:03Magistrsko delo/naloga114392VisID: 72782sl