Vloga gena PEX11 in identifikacija novih genov z vplivom na lipidni metabolizem kvasovke Saccharomyces cerevisiaeOgrizović, Mojca (Avtor) Petrovič, Uroš (Mentor) Pex11membranski protein peroksisomovproteinske interakcijemedorganelno stikigenetske potimetabolizem lipidovpoligenska lastnostkvantitativni lokuspleitrofnostPeroksisomi in lipidne kapljice so ključni organeli pri vzdrževanju homeostaze metabolizma lipidov v kvasovki Saccharomyces cerevisiae. Na strani peroksisomov smo preučevali membranski protein Pex11, ki je potreben za elongacijo in cepitev peroksisomov, vpliva pa tudi na izražanje genov glikolize. Na strani lipidnih kapljic smo ovrednotili doprinos kandidatnih vzročnih genov MKT1, PHO23, PIG1 in RML2 na kopičenje založnih lipidov in iskali morebitne dodatne genetske elemente tega fenotipa. Z membranskim dvo-hibridnim sistemom kvasovke in bi-molekularnim fluorescenčnim dopolnjevanjem smo odkrili interakcijo med proteinom Pex11 in membranskim proteinom mitohondrijev, Mdm34. Z uporabo fluorescenčnih označevalcev za peroksisome in mitohondrije smo ugotovili, da je interakcija Pex11-Mdm34 pomembna za oblikovanje sidra PerMES (Peroksisom-ERMES), potrebnega za neposredno bližino peroksisomov in mitohondrijev. Da bi pojasnili povezavo osrednjega in lipidnega metabolizma preko gena PEX11, smo merili jakost izražanja genov za encime glikolize in ugotovili, da gen RLF2 ojača izražanje gena za enolazo ENO1, pri čemer je gen PEX11 ključen. Z zamenjavami alelov kandidatnih vzročnih genov med sevoma z različno vsebnostjo založnih lipidov ter z inaktivacijo teh genov v obeh sevih smo pokazali, da so aleli PHO23AWRI, PIG1AWRI in RML2S288c superiorni za stopnjo kopičenja založnih lipidov. S povratnim križanjem z obema sevoma pa smo odkrili dodatne genetske elemente, ki potencialno pripomorejo h kopičenju založnih lipidov. Raziskava je pomembno prispevala k razumevanju vloge proteina Pex11, ki je neodvisna od proliferacije peroksisomov, ter osvetlila genetsko arhitekturo kopičenja založnih lipidov v kvasovki S. cerevisiae.[M. Ogrizović]20192019-12-28 07:45:36Doktorsko delo/naloga113388UDK: 602.3:582.282.23:601.4:577.21(043.3)VisID: 175311COBISS_ID: 9386873sl