Mikrobna združba sedimentov reke Kamniške Bistrice in frekvenca konjugacijskega prenosaSkamen, Urška (Avtor) Starčič Erjavec, Marjanca (Mentor) Mori, Nataša (Komentor) Kamniška Bistricasedimentmikrobne združbeEscherichia coliprenos genovfrekvenca konjugacijeEscherichia coli je bakterija, ki je del črevesne mikrobiote ljudi in živali s stalno telesno temperaturo ter pri zdravih ljudeh običajno ne povzroča bolezni. Iz črevesja se E. coli z iztrebki izloča v naravo, kjer lahko preživi in se pod določenimi pogoji tudi razmnožuje. Bakterijski sevi, ki v naravnem okolju preživijo, se morajo zaradi selekcijskega pritiska hitro prilagajati na spreminjajoče se okolje, vključno na prisotnost antibiotikov. To jim med drugim omogočajo tudi konjugacija ter drugi horizontalni prenosi genov. Cilj magistrskega dela je bil ugotoviti, ali je E. coli zmožna konjugacijskega prenosa plazmida pKJK5 v rečnih sedimentih Kamniške Bistrice. Prav tako nas je zanimalo, kakšna je sestava mikrobne združbe sedimentov reke Kamniške Bistrice. Frekvenco konjugacijskega prenosa smo ugotavljali na trdnih bakterijskih gojiščih in v sedimentih v prisotnosti in odsotnosti hranil ter pri različnih temperaturah. Ugotovili smo, da frekvenca konjugacije pada s temperaturo in je še posebej pri nižjih temperaturah odvisna od prisotnosti hranil. Mikrobno združbo sedimentov reke Kamniške Bistrice smo določali z metodo sekvenciranja naslednje generacije (tarčno sekvenciranje PCR - pomnožkov gena za 16S rRNA). Ugotovili smo, da največji delež mikrobne združbe spada v debla Proteobacteria, Nitrospirae, Bacteroidetes in Cyanobacteria.[U. Skamen]20192019-10-19 07:45:02Magistrsko delo/naloga111992UDK: 579.25/.26:579.842.1/.2:577.2.083VisID: 172008COBISS_ID: 5111672sl