Razvoj metode z zanko posredovanega izotermalnega pomnoževanja za določanje gliv rodu Verticillium.Grgič, Zarja (Avtor) Štajner, Nataša (Mentor) Radišek, Sebastjan (Komentor) VerticilliumidentifikacijaLAMPmolekularna genetikazačetni oligonukleotidiPCRpatogene gliveGlive rodu Verticillium predstavljajo ene izmed najbolj škodljivih rastlinskih patogenov. Predstavniki rodu lahko parazitirajo širok spekter gostiteljskih rastlin, med katerimi je tudi veliko gospodarsko in kmetijsko pomembnih kultur. V Sloveniji največ škode povzročata vrsti V. nonalfalfae, ki povzroča blago in letalno obliko verticilijske uvelosti hmelja in V. dahliae. Za lažje nadzorovanje in preprečevanje širjenja bolezni, je ključnega pomena razvoj ustreznih diagnostičnih metod, ki bi omogočile hitro in zanesljivo identifikacijo ter razločevanje med posameznimi vrstami in patotipi. Cilj naše raziskave je vključeval razvoj metode LAMP za hitro in učinkovito določanje vrst rodu Verticillium ter letalnega patotipa vrste V. nonalfalfae (PG2). Ker je za obravnavan rod fitopatogenih gliv značilna velika heterogenost, smo izvedli tudi molekularno analizo variabilnosti. Preko pomnoževanja DNA z začetnimi oligonukleotidi, specifičnimi za letalno regijo patotip PG2, smo želeli pokazati veliko heterogenost znotraj posameznih vrst gliv rodu Verticillium in težavnost uporabe ustrezne diagnostične metode ter načrtovanja začetnih oligonukleotidov, ki bi omogočili razločevanje med vrstami in patotipi tega rodu.[Z. Grgič]20192019-09-22 07:47:30Magistrsko delo/naloga111070UDK: 601.4:577.21:602:632.4(043.2)VisID: 169873COBISS_ID: 9362041sl