Pregled kemoinformacijskih metod za napoved metabolitovKorošec, Anja (Avtor) Podlipnik, Črtomir (Mentor) metabolizemmetabolične potimetabolitikvantifikacijaidentifikacijaMetabolizem je proces sočasnega in usklajenega potekanja številnih večstopenjskih kemijskih reakcij v organizmu. Te reakcije so kataboličnega ali anaboličnega tipa in so med seboj povezane v značilne metabolične poti. Glavni regulatorji omenjenih reakcij so specifični encimi. Ksenobiotiki so kemijske substance zunanjega izvora, ki so prisotne v organizmu. Njihov metabolizem poteka s pomočjo specifičnih ksenobiotskih encimov in je za organizem izrednega pomena. Ena glavnih takšnih skupin encimov je družina citokromskih P450 monooksigenaz. Proces metabolizma zelo pomembno vpliva na farmakodinamske lastnosti ksenobiotikov in njihovih metabolitov, kar lahko povzroči neželene posledice. Za napovedi metaboličnih poti in prepoznavi nastalih produktov, so se razvile številne metode, ki jih delimo na teoretične in eksperimentalne. Eksperimentalne metode so osnovane na inštrumentalnih analitskih metodah, ena izmed boljših je LC-MS/MS, poznamo pa tudi druge. Služijo direktni kvantitativni in kvalitativni določitvi metabolitov v različnih bioloških vzorcih. Teoretične metode so osnovane na računalniških bazah podatkov in posebnih programskih orodjih, s katerimi napovedujemo potek metaboličnih procesov in identificiramo produkte. Omenjene metode pokrivajo različne tipe metabolizmov, večina se jih osredotoča na človeški metabolizem in delovanje človeških metaboličnih encimov. V tej diplomski nalogi so predstavljene in preizkušene prosto dostopne internetne programske opreme: BioTransformer, GLORY in KEGG Pathway Database. Vsaka izmed njih ima svoj način napovedovanja in zbiranja podatkov.20192019-09-05 13:30:17Diplomsko delo/naloga109547VisID: 6323COBISS_ID: 1538314691sl