Biotehnološka uporaba bakterijskih mikrorazdelkov.Otoničar, Jan (Avtor) Butala, Matej (Mentor) proteinski organeliSalmonella entericabakterijski mikrorazdelkiizolacija proteinovBakterijski mikrorazdelki so proteinski organeli, ki se samo-sestavijo in vključujejo encime, ki izvajajo specifične metabolne procese. Bakterija Salmonella enterica nosi zapis za ene večjih mikrorazdelkov, ki so zapisani na operonu Pdu in so udeleženi pri razgradnji 1,2-propandiola. Mikrorazdelek Pdu gradijo podenote Pdu A, B, B', J, K, N, T, U, ki se najprej samo-sestavijo v homoheksamere oziroma homopentamere, šele nato lahko postanejo gradniki organela. V mikrorazdelek se ponavadi tekom njegove izgradnje vključijo encimi, ki nosijo kratke peptidne značke, s katerimi interagirajo s podenotami organela. Če katero izmed teh peptidnih sekvenc združimo s poljubnim proteinom, lahko dosežemo njegovo pakiranje v mikrorazdelek. Prav zaradi te možnosti so mikrorazdelki biotehnološko zanimivi. Ob zapakiranju encimov določene metabolne poti, lahko dosežemo večjo produktivnost za tarčni produkt, npr. za etanol, ali pa zapakiramo encime metabolne poti, kjer so vmesni intermediati toksični za celico. Zaradi selektivne prepustnosti so mikrorazdelki primerni tudi za sintezo toksičnih proteinov, saj ti ob zapakiranju v organel, ne morejo prosto prehajati po celici. Zavoljo razvoja metode za analizo interakcij protein-DNA smo v laboratoriju v kapside Pdu uspeli zapakirati transkripcijski faktor LacI, ki je imel na amino-terminalnem koncu kratko peptidno sekvenco proteina PduD in na karboksi-terminalnem koncu izboljšani fluorescenčni protein (EGFP). Zasnova eksperimenta omogoča, da celotne mikrorazdelke izoliramo z afinitetno kromatografijo.[J. Otoničar]20192019-08-24 07:45:27Diplomsko delo/naloga109167UDK: 579.6:601.2:602.6:579.8(043.2)VisID: 166349COBISS_ID: 9282937sl