Vpliv modulacije črevesne mikrobiote na kolonizacijo z bakterijo Clostridium difficileMahnič, Aleksander (Avtor) Rupnik, Maja (Mentor) Clostridium difficilečrevesna mikrobiotabakterijegliveamplikon sekvenciranjepolifenolni ekstraktgranatno jabolkoborovnicein vitro model prebavnega traktaClostridium sporogenesBakterijo Clostridium difficile uvrščamo med najpogostejše povzročitelje okužb gastrointestinalnega trakta, pri čemer je ključen pogoj za uspešno kolonizacijo bakterije predhodno porušena črevesna mikrobiota. V okviru doktorske disertacije smo proučevali vpliv modulacije črevesne mikrobiote na kolonizacijo z bakterijo C. difficile s ciljem da identificiramo mikroorganizme ali konzorcije mikroorganizmov, ki sodelujejo v kolonizacijski odpornosti proti tej bakteriji. V populacijski študiji smo analizirali skupino hospitaliziranih bolnikov s kroničnimi vnetnimi črevesnimi boleznimi (KVČB, n = 40), saj je pri njih mikrobiota modulirana zaradi kroničnega obolenja in so posledično izpostavljena skupina za razvoj okužbe z bakterijo C. difficile. V primerjavi z ostalimi hospitaliziranimi bolniki (prva kontrolna skupina, n = 81) ter skupino zdravih prostovoljcev (druga kontrolna skupina, n = 160) smo pokazali, da je črevesna mikrobiota bolnikov s KVČB povezana z bolj izrazitimi znaki porušenja. Stopnja kolonizacije z bakterijo C. difficile se med skupinama hospitaliziranih bolnikov ni razlikovala, je pa bila značilno višja kot v zdravi populaciji. Glivna združba se ni razlikovala med koloniziranimi ter ne-koloniziranimi z bakterijo C. difficile, smo pa v povezavi s koloniziranostjo pokazali razlike v bakterijski združbi bolnikov brez KVČB. Poročamo 11 diferencialno zastopanih bakterijskih skupin, med njimi sta najbolj izrazita s kolonizacijo povezan porast predstavnikov iz rodu Enterococcus ter upad rodu Faecalibacterium. Z in vitro modulacijo črevesne mikrobiote z antibiotiki in ekstrakti polifenolov (PE) smo pokazali, da PE granatnega jabolka (mezokarp) ter PE borovnic v nasprotju s pričakovanji ne povečata kolonizacijske rezistence proti bakteriji C. difficile. Ugotovili smo, da specifični vzorci v bakterijski združbi neodvisno korelirajo z rastjo bakterije C. difficile ter aktivnostjo toksinov TcdA in TcdB, ki jih bakterija proizvaja. Uspešno smo osamili tri bakterijske izolate ter pokazali, da bakterija Clostridium sporogenes v ko-kulturi značilno zmanjša aktivnost toksinov bakterije C. difficile, medtem ko na rast bakterije ne vpliva.20192019-06-14 07:45:04Doktorsko delo/naloga108061VisID: 163838COBISS_ID: 932727sl