Analiza genetskih in metilacijskih sprememb gena MKRN3 pri bolnikih s prezgodnjo pubertetoNovak, Eva (Avtor) Trebušak Podkrajšek, Katarina (Mentor) Avbelj Stefanija, Magdalena (Komentor) Družinska centralna prezgodnja pubertetasekvenciranje po SangerjuMS-MLPAMKRN3nova kandidatna spremembaO prezgodnji puberteti govorimo, kadar se znaki pubertetnega razvoja pojavijo pred pričakovano starostjo. Pri dečkih se poveča velikost mod, deklicam se pričnejo razvijati prsi, kosti pa pospešeno rastejo in dozorevajo. Nastop pubertete je pod velikim vplivom socialnih in okoljskih dejavnikov, na področju centralne prezgodnje pubertete pa sta genetika in epigenetika predmet intenzivnega raziskovanja. Gre za obliko prezgodnje pubertete, ki nastane zaradi prezgodnje aktivacije hipotalamično-hipofizno-gonadne osi. V približno četrtini primerov centralne prezgodnje pubertete govorimo o družinski prezgodnji puberteti. Uporaba molekularne genetike je zato pomembna v procesu določitve morebitnega genetskega vzroka bolezni in za potrebe genetskega testiranja družinskih članov bolnikov. Namen magistrske naloge je bil v populaciji sporadičnih bolnikov in bolnikov z družinsko centralno prezgodnjo puberteto ter njihovih družinskih članih opredeliti vzročne spremembe v genu MKRN3. Nukleotidno zaporedje kodirajoče regije gena smo določili s sekvenciranjem po Sangerju. Pri bolnikih, ki s sekvenciranjem niso imeli opredeljenih vzročnih sprememb, družinska anamneza pa je nakazovala na paternalno dedovano centralno prezgodnjo puberteto, smo z metodo MS-MLPA iskali spremembe v številu kopij in metilacijskem vzorcu gena MKRN3 in DLK1. S sekvenciranjem po Sangerju smo v dveh rodovnikih z družinsko centralno prezgodnjo puberteto odkrili in potrdili predhodno že opisano vzročno spremembo, v enem rodovniku pa smo opredelili potencialno novo kandidatno varianto. Z in silico napovednimi algoritmi in segregacijsko analizo smo dokazali patološkost nove variante. Pri preiskovancih s sporadično obliko bolezni nismo odkrili vzročnih sprememb v kodirajoči regiji gena MKRN3. Določili nismo nobenih delecij/duplikacij in metilacijskih nepravilnosti v genih MKRN3 in DLK1, zato smo razpravljali o omejitvah MS-MLPA metode. S sekvenciranjem po Sangerju je mogoče opredeliti vzročne spremembe v genu MKRN3. Z analizo smo razširili spekter variant, povezanih s centralno prezgodnjo puberteto, v prihodnosti pa bo ključna identifikacija novih tarčnih genov reproduktivne osi.20192019-06-11 08:49:39Magistrsko delo/naloga107976VisID: 67198sl