Določanje proteinov, vezanih na dipeptidne ponovitveMarkič, Lara (Avtor) Rogelj, Boris (Mentor) biotehnologijanevrodegeneracijaproteiniinteraktorjiamiotrofičnalateralnasklerozafrontotemporalnademencaC9orf72C9-ALSALSdipeptidneponovitveRAN-translacijaCelični mehanizmi, odgovorni za nastanek patologije, ki vodi v amiotrofično lateralno sklerozo, še niso dobro poznani in trenutno ni zdravil, ki bi bolezen pozdravila. Proteini z dipeptidnimi ponovitvami (DPR), ki se prevajajo iz podaljšanih heksanukleotidnih ponovitev znotraj gena C9orf72, imajo sposobnost vezave na različne znotrajcelične proteine. Le-ti pri bolnikih z amiotrofično lateralno sklerozo nastanejo pri posebni obliki translacije, ki poteka neodvisno od začetnega kodona AUG. V nalogi smo izražali pet različnih zvrsti dipeptidnih ponovitev (poli (GA), poli (GP), poli (GR), poli (PA) in poli (PR)), ki smo jih konjugirali z encimom BioID2, in z metodo BioID poiskali kandidatne celične proteine, ki se prehodno ali stalno vežejo na DPR, ali pa se nahajajo v njihovi bližini. Z ontološkimi analizami kandidatnih proteinov smo določili, da so proteini poli (GA) vpleteni v procese, povezane z mikrotubuli, in v katabolične procese proteinov; proteini poli (GP) vpleteni v procese prenosa signala; proteini poli (GR) vpleteni v procese začetka prevajanja proteinov in metabolične procese amidov; proteini poli (PA) vpleteni v uravnavanje encimske aktivnosti in pozitivnega uravnavanja apoptoze; proteini poli (PR), vpleteni v procesiranje rRNA. Z magistrsko nalogo smo prispevali nova spoznanja o celičnih mehanizmih pri najpogostejši mutaciji amiotrofične lateralne skleroze, ki bodo, skupaj z nadaljnjimi raziskavami, pripomogla k boljšemu razumevanju bolezni in novim načinom zdravljenja ali preprečevanja bolezni.[L. Markič]20192019-05-07 10:32:31Magistrsko delo/naloga107622UDK: 606:616.8-009.5:577.1:576.54(043.2)VisID: 163683COBISS_ID: 9215609sl