Biološka vloga interakcije bakterijskih egerolizinov z lipidiKočar, Eva (Avtor) Butala, Matej (Mentor) egeroliziniPseudomonas aeruginosaRahUceramid fosfoetanolaminrojenjeProtein RahU, ki ga sintetizira bakterija Pseudomonas aeruginosa, uvrščamo v proteinsko družino egerolizinov (Pfam 06355), ki vključuje predstavnike predvsem iz gliv in bakterij. Skupna lastnost glivnih in bakterijskih egerolizinov je njihova vezava na membranske lipide, nekateri izmed njih pa vsebujejo hemolitično in toksično aktivnost proti evkariontskim celicam. RahU veže oksidiran lipoprotein nizke gostote, lizofosfatidilholin ter bakterijske biosurfaktante ramnolipide. Z namenom prepoznave biološke pomembnosti interakcije egerolizina RahU z lipidi, smo uvedli aminokislinske zamenjave v okolici amino-terminalnega konca proteina RahU in s pomočjo heterolognega ekspresijskega sistema Escherichia coli pridobili rekombinanten protein RahU ter njegove različiče. Dokazali smo, da omenjene zamenjave ne vplivajo na pravilno zvitje in stabilnost mutantov. S testom sedimentacije multilamelarnih veziklov in površinsko plazmonsko resonanco smo pokazali vezavo RahU s ceramid fosfoetanolaminom, poglavitnim sfingolipidom v membranah nevretenčarjev. RahU je tako prvi znani bakterijski egerolizin, ki veže omenjeni lipid. Prav tako smo pokazali vezavo RahU z O-fosforiletanolaminom ter nevroendokrinim hormonom noradrenalinom, testi rojenja sevov bakterije Pseudomonas aeruginosa PA01, PW1205 in PW1206 pa so pokazali, da egerolizin RahU oslabi rojenje teh bakterij.20192019-05-07 10:31:44Magistrsko delo/naloga107612VisID: 163673COBISS_ID: 5068623sl