Mikrobiota kože človeške ribice (Proteus anguinus)Prodan, Ylenia (Avtor) Kostanjšek, Rok (Mentor) Trontelj, Peter (Komentor) človeška ribicaProteus anguinuskožni mikrobiommikrobne združbe16S rRNAsekvenčne reakcije naslednje generacijemetagenomska analizaKljub temu, da je človeška ribica najbolj prepoznavna žival dinarskega podzemlja, sta njena biologija in ekologija zaradi težke dostopnosti njenega naravnega okolja še vedno slabo raziskani. Zaradi prepoznanega pomena kožne mikrobiote za zdravje in dobrobit vretenčarskih gostiteljev, smo se v nalogi odločili podrobneje raziskati kožni bakteriom človeške ribice. Profil bakterijske združbe na koži človeške ribice smo raziskali z metagenomsko analizo sedmih vzorcev kože in enega vzorca vode. Prevladujoči taksoni, najdeni v vseh vzorcih kože, so bili: Sphingomonadaceae, Bradyrhizobiaceae, Microbacterium, Burkholderiaceae in Flavobacteriaceae. Ti po vsej verjetnosti izvirajo iz vodnega okolja in najverjetneje predstavljajo normalno mikrobioto kože človeške ribice. Primerjava bakterijske združbe kože istega osebka v dveh zaporednih letih kaže tako na ohranjenost prevladujočih taksonov, kot tudi na časovno dinamiko manjšega dela kožnega bakterioma človeške ribice. Med vzorci izrazito odstopa vzorec s kože črne človeške ribice. Ta je izjemno obremenjen z enterobakterijami in aeromonadami, ki skoraj povsem izrivajo taksone normalne kožne mikrobiote. Normalna kožna mikrobiota človške ribice doslej ni bila poznana, njena prisotnost pa ima velik potencial pri ohranjanju te ogrožene vrste in zagotavljanju ustreznih pogojev pri njenem gojenju v umetnih in seminaravnih pogojih.[Y. Prodan]20182018-06-01 07:45:02Magistrsko delo/naloga101419UDK: 579.25/.26:597.92:577.2.088VisID: 151271COBISS_ID: 4910968sl