Analiza strukture genske variabilnosti in izdelava jedrne zbirke kultivarjev jablan finske kolekcijeRaspor, Andrej (Avtor) Štajner, Nataša (Mentor) Bitz, Lidija (Komentor) jablanamikrosatelitijedrna zbirkagenetska variabilnostgenetska bankaJablana (Malus domestica Borkh.) je sadno drevo iz družine rosaceae. Je tretja najbolj gojena sadna vrsta, njena pridelava pa je razširjena po celem svetu. Na Finskem jablana sodi med ekonomsko manj pomembne kulturne rastline, vendar je priljubljeno vrtno in kmetijsko drevo ter ima zgodovinsko in kulturno pomembno vlogo. Zaradi lege Finske, ki predstavlja najsevernejšo regijo, kjer jablana še uspeva, so sorte, ki rastejo tu, posebej zanimive z vidika genetske raznovrstnosti. V tej študiji smo analizirali finske sorte jablan z namenom določitve jedrne zbirke. Za namene te študije smo zbrali 704 vzorcev jablan, ki rastejo širom Finske in izolirali njihovo DNK. Genetska identiteta vzorcev je bila analizirana s 7 mikrosatelitskimi markerji SSR (simple sequence repeat). Študije genetske strukture so pokazale, da je raven genetske variabilnosti finskih jablan (He = 0,8, Ae = 6,2) primerljiv z drugimi evropskimi populacijami jablan. Na podlagi dobljenih genetskih podatkov smo določili genotipe, ki predstavljajo jedrno zbirko, ki jo sestavlja 37 enot. Uporabili smo šest različnih metod izgradnje jedrne zbirke in jih primerjali med sabo. Na osnovi primerjav različnih parametrov smo izbrali najboljšo med njimi, in sicer jedrno zbirko, osnovano s programom CoreFinder. Podane so tudi smernice za implementacijo, vzdrževanje in uporabo pripravljene jedrne zbirke.[A. Raspor]20172017-10-20 07:15:11Magistrsko delo/naloga97123sl