Primerjava in genetska opredelitev dveh sevov virusa ZikaSmlatić, Nuša (Avtor) Avšič Županc, Tatjana (Mentor) Korva, Miša (Komentor) virusiFlavivirusivirus Zikaklinični vzorcimolekularne metodenukleotidna zaporedjasekveniranjefilogenetska analizagenetska raznolikostVirus Zika uvrščamo v družino Flaviviridae ter med viruse, ki jih prenašajo členonožci. Ljudje se z virusom okužijo z vbodom okuženih komarjev iz rodu Aedes, virus se lahko med nosečnostjo ali porodom prenese tudi iz okužene matere na otroka. Večina okužb z virusom Zika poteka brez kliničnih znakov bolezni, lahko pa pride do resnejših nevroloških zapletov, kot sta sindrom Guillain-Barré in mikrocefalija pri novorojenčkih. Virus izvira iz vzhodne Afrike, nato se je razširil v dve smeri, v zahodno Afriko in nato v Azijo. Tako sta se pojavili dve genetski liniji; Afriška linija in Azijska linija. V magistrskem delu smo primerjali dva seva virusa Zika: sev #976, ki je bil izoliran leta 1947 iz vzorca krvi opice iz Ugande in sev 800/16, ki so ga izolirali maja 2016 iz seruma viremične bolnice, ki se je vrnila iz Brazilije in je kazala značilne klinične znake okužbe z virusom Zika. Ugotovili smo, da so za gojenje preiskovanih virusnih sevov primerne celične linije iz opičjih ledvičnih epitelijskih celic VERO E6, celična linija iz komarjevih celic C6/36 in celična linija iz celic človeškega neuroblastoma SK-N-SH. Virusna seva sta povzročila CPU na celični liniji VERO E6 in SK-N-SH, ne pa na celični liniji C6/36. Določili smo nukleotidno in aminokislinsko zaporedje celotnih genomov. Ugotovili smo, da je virus Zika, sev #976, eden od izolatov tipskega seva virusa Zika MR766, ki so jih izolirali leta 1947 v Ugandi in sodi v Afriško linijo ZIKV. Sev 800/16 spada v Azijsko linijo in je zelo podoben sevom, ki so v letih 2015 in 2016 povzročili epidemijo v Južni in Srednji Ameriki ter na Karibih.[N. Smlatić]20172017-08-24 07:15:23Magistrsko delo/naloga94426sl