Razlikovanje mikobakterij iz sklopa Mycobacterium (M.) avium in M. abscessus ter določanje občutljivosti za najpomembnejša protimikrobna sredstvaTruden, Sara (Avtor) Starčič Erjavec, Marjanca (Mentor) Žolnir Dovč, Manca (Komentor) mikobakterijenetuberkulozne mikobakterijeMycobacterium aviumMycobacterium abscessusmolekularne metodeidentifikacija bakterijERIC-PCRGenoType NTM-DRprotimikrobne učinkovineantibiotikiNetuberkulozne mikobakterije (NTM) so okoljski oportunistični patogeni. So nesporogeni, negibljivi, aerobni bacili, ki imajo v celični steni mikolno kislino, katera je odgovorna za večino lastnosti mikobakterijskih celic. Mikobakteriozo najpogosteje povzročajo mikobakterije iz sklopa Mycobacterium avium (MAC) in Mycobacterium abscessus (MABSC). Taksonomija znotraj sklopov MAC in MABSC se je v zadnjem času zelo spreminjala zaradi vpeljave novih molekularnih tehnik, ki omogočajo razlikovanje vrst. Tako je sklop M. avium pridobil novo vrsto Mycobacterium chimaera, ki je bila pred tem prepoznana kot vrsta Mycobacterium intracellulare in sklop M. abscessus je razpadel na tri podvrste. Ker so NTM okoljski mikroorganizmi, so konstantno izpostavljeni različnim koncentracijam razkužil in drugim protimikrobnim sredstvom in posledično so NTM razvile različne mehanizme odpornosti. Makrolidi in aminoglikozidi so najpogosteje uporabljeni antibiotiki za zdravljenje okužb, ki jih povzročajo bakterije iz sklopov MAC in MABSC. Z diagnostičnim kompletom GenoType NTM-DR (Hain Lifescience GmbH) smo analizirali 139 izolatov mikobakterij, pridobljenih iz Nacionalne zbirke mikobakterijskih izolatov Laboratorija za mikobakterije Klinike Golnik, ki pripadajo sklopu MABSC in vrsti M. intracellulare. Preverili smo, katera podvrsta sklopa MABSC je najbolj pogosta v Sloveniji in koliko analiziranih izolatov je s to metodo prepoznanih kot M. chimaera. Hkrati smo pridobili informacije o prisotnosti mutacij v genih, ki posredujejo odpornost proti makrolidom in aminoglikozidom. Poleg tega smo preizkusili metodo ERIC-PCR in preverili ali razlikuje izolate in seve med seboj. Ugotovili smo, da 48,5 % analiziranih izolatov pripada vrsti M. chimaera in da je M. abscessus subsp. abscessus najpogosteje prisotna podvrsta sklopa MABSC. Večino naših izolatov sklopa MABSC je odpornih proti makrolidom, medtem ko so vsi izolati sklopov MAC in MABSC občutljivi za aminoglikozide. Pokazali smo, da metoda ERIC-PCR razlikuje med izolati in sevi mikobakterij sklopov MAC in MABSC.[S. Truden]20172017-07-28 07:15:11Magistrsko delo/naloga94335sl