Genotipizacija glive Pneumocystis jirovecii izolirane iz kužnin bolnikov s pnevmocistozoRobič, Erika (Avtor) Keše, Darja (Mentor) Šoba, Barbara (Komentor) bolezni dihalpljučnicapatogene glivepnevmocistozaPneumocystis jiroveciibolnišnične okužbegenotipizacijske metodegenotipizacijametoda MLSTsekvenčni tipikužnine bolnikovimunokompromitirani bolnikiGliva Pneumocystis jirovecii je oportunistični patogen, ki povzroča pnevmocistozo (PCP) pri imunokompromitiranih bolnikih. Človek je njen edini gostitelj, med ljudmi se prenaša z aerosoli. PCP se pojavlja predvsem v bolnišničnem okolju, kjer lahko prihaja tudi do izbruhov. Za razumevanje epidemioloških značilnosti glive se v današnjem času uporabljajo genotipizacijske metode, predvsem genotipizacija na podlagi zaporedij več lokusov ali MLST (angl. Multilocus Sequence Typing). V naši raziskavi smo glivo pri bolnikih s PCP genotipizirali na podlagi petih lokusov: DHPS, ß-tubulin, mt26S rRNA, CYB in SOD. V raziskavo smo vključili 73 respiratornih vzorcev 53 bolnikov, ki smo jih prejeli od januarja 2012 do decembra 2014. Glivo smo uspešno genotipizirali pri 40 vzorcih 32 bolnikov. Ugotovili smo 15 različnih sekvenčnih tipov P. jirovecii, ki se razvrščajo v sedem genotipskih skupin. Na podlagi te genotipizacije in dostopnih epidemioloških podatkov o pregledanih bolnikih predvidevamo, da med leti 2012 in 2014 na oddelkih Onkološkega inštituta Ljubljana in klinikah Univerzitetnega kliničnega centra Ljubljana ni bilo izbruhov PCP, vendar ne moremo izključiti nekaj posameznih prenosov med bolniki. Za razjasnitev le-teh bi potrebovali dodatne epidemiološke podatke o bolnikih.[E. Robič]20172017-06-24 07:15:10Magistrsko delo/naloga92650sl