<?xml version="1.0"?>
<rdf:RDF xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#" xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/"><rdf:Description rdf:about="https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=30574"><dc:title>Določanje soodvisnih sprememb proteinov z uporabo grafičnih procesnih enot</dc:title><dc:creator>Bevk,	Jani	(Avtor)
	</dc:creator><dc:creator>Lotrič,	Uroš	(Mentor)
	</dc:creator><dc:creator>Curk,	Tomaž	(Komentor)
	</dc:creator><dc:subject>analiza soodvisnih sprememb proteinov</dc:subject><dc:subject>OMES</dc:subject><dc:subject>splošno-namensko računanje na grafičnih procesnih enotah</dc:subject><dc:subject>CUDA</dc:subject><dc:subject>računalništvo</dc:subject><dc:subject>računalništvo in informatika</dc:subject><dc:subject>univerzitetni študij</dc:subject><dc:subject>diplomske naloge</dc:subject><dc:description>Proteini sodelujejo v skoraj vseh procesih, ki se odvijajo v celicah živečih organizmov. Razumevanje njihovih funkcij je ključnega pomena za razumevanje bioloških procesov. Soodvisne spremembe v proteinih, ki se tekom njihove evolucije odvijajo, so tesno povezane z njihovo strukturo in funkcijo. Razvitih je bilo več različnih algoritmov za detekcijo soodvisnih sprememb, vsi pa so računsko zelo zahtevni. Eden izmed takšnih algoritmov je algoritem OMES, ki temelji na statističnem testu χ² in naključnem mešanju poravnav proteinskih zaporedij. Cilj diplomske naloge je paralelizacija in implementacija algoritma OMES na grafični procesni enoti z uporabo platforme CUDA. Grafične procesne enote so specializirani procesorji, ki danes najverjetneje nudijo najboljše razmerje med računsko močjo in ceno. V primerjavi z implementacijo na centralni procesni enoti smo dosegli stokratne pohitritve in porabili manj energije.</dc:description><dc:publisher>[J. Bevk]</dc:publisher><dc:date>2015</dc:date><dc:date>2015-02-16 16:15:13</dc:date><dc:type>Diplomsko delo/naloga</dc:type><dc:identifier>30574</dc:identifier><dc:language>sl</dc:language></rdf:Description></rdf:RDF>