Načrtovanje, sinteza in vrednotenje karbamoil fluoridov kot zaviralcev serinske hidrolaze FphI iz Staphylococcus aureusPrestreši, Leonora (Avtor) Knez, Damijan (Mentor) Meden, Anže (Komentor) Staphylococcus aureusFphIserinske hidrolazekarbamoil fluoridikovalentni zaviralciProtimikrobna odpornost bakterije Staphylococcus aureus predstavlja enega največjih izzivov sodobne medicine in spodbuja razvoj novih terapevtskih pristopov, usmerjenih proti bakterijskim virulentnim dejavnikom. Med obetavne tarče sodi serinska hidrolaza FphI, za katero specifični zaviralci z nizko molekulsko maso doslej še niso bili opisani. V magistrski nalogi smo sintetizirali knjižnico karbamoil fluoridov in ovrednotili njihovo zaviralno aktivnost na encimu FphI. Biokemijsko vrednotenje je omogočilo identifikacijo več visoko aktivnih zaviralcev z aktivnostjo v nanomolarnem območju. Kinetične študije so potrdile njihov dvostopenjski kovalentni mehanizem delovanja, masna spektrometrija in rentgenska kristalografija pa sta potrdili kovalentno vezavo na katalitični Ser94 ter razkrili način vezave v aktivnem mestu encima. Molekulsko modeliranje in simulacije molekulske dinamike so pokazale, da je za učinkovito zaviranje ključna tvorba kovalentne vezi med karbamoil fluoridno skupino in katalitičnim serinskim ostankom, medtem ko nekovalentne interakcije same po sebi ne zagotavljajo stabilne vezave ligandov. Izbrane spojine niso imele izrazite protibakterijske aktivnosti. Rezultati magistrske naloge predstavljajo prve opisane kovalentne zaviralce encima FphI ter pomembno prispevajo k razumevanju njegovega mehanizma delovanja in biološke vloge. Razvite spojine predstavljajo obetavno izhodišče za nadaljnji razvoj selektivnih zaviralcev FphI in kemijskih sond za preučevanje biološke vloge tega encima, ne pa za razvoj novih antibiotikov proti bakteriji Staphylococcus aureus.[L. Prestreši]20262026-09-03 08:47:35Magistrsko delo/naloga186593sl