Analiza regulacije izražanja gena Pla2g4e in njegovih kolokaliziranih paralogov pri miši (Mus musculus)Kokovnik, Bert (Avtor) Horvat, Simon (Mentor) genetikaPla2g4bPla2g4dPla2g4ePla2g4fizražanje genovparalogni genikoekspresijadebelostlaboratorijske mišivitka linijadebela linijaDebelost je kompleksna bolezen, pri kateri pomembno vlogo igrajo okoljski in genetski dejavniki. Za preučevanje te bolezni se pogosto uporabljajo mišji modeli, pri čemer selekcijski liniji debelih (FLI) in vitkih (FHI) miši predstavljata enega najboljših modelov poligenske debelosti. V genskem skupku kolokaliziranih citosolnih fosfolipaz A2 na kromosomu 2, ki vključuje gene Pla2g4b, Pla2g4d, Pla2g4e in Pla2g4f, je bil Pla2g4e predhodno identificiran kot kandidatni gen za debelost. Z bioinformatskimi analizami so bile identificirane regulatorne regije, ki so potencialno odgovorne za diferencialno izražanje tega gena med debelo in vitko linijo miši. Prvi cilj te magistrske naloge je bil preveriti, ali imajo variacije v zaporedju DNA v izbranih regijah vpliv na izražanje gena Pla2g4e, za kar smo uporabili luciferazni reporterski test. Rezultati za testirani regiji niso pokazali statistično značilnih razlik v regulatorni aktivnosti med debelo in vitko linijo, pri čemer trend v regiji F1/R1 nakazuje možen vpliv alelov. Drugi cilj je bil analizirati vzorce izražanja vseh štirih kolokaliziranih paralognih genov in ugotoviti, ali so podvrženi koekspresiji. Analiza qPCR v naboru tkiv miši linije C57BL/6, podlinije J je pokazala, da imajo kolokalizirani paralogni geni izrazito različne, tkivno specifične profile izražanja. Korelacijska analiza po Spearmanu je pokazala statistično značilno korelacijo med ekspresijskim profilom Pla2g4b in vsemi tremi ostalimi geni, medtem ko korelacije med preostalimi pari niso bile statistično značilne. Rezultati podpirajo funkcionalno divergenco kolokaliziranih paralogov ter nakazujejo, da diferencialno izražanje gena Pla2g4e ni zgolj posledica skupne regulacije celotnega genskega skupka, temveč odraža njegovo specifično regulacijo.20262026-09-03 07:17:44Magistrsko delo/naloga186543sl