Pregled tehnik določanja mikrobioma človekaTrebec, Meta (Avtor) Podgornik, Aleš (Mentor) človeški mikrobiommikrobiotamolekularne metodemetagenomikametatranskriptomikametaproteomikametabolomikamulti-omska analizaDiplomsko delo obravnava sodobne pristope za preučevanje človekovega mikrobioma s poudarkom na primerjavi gojitvenih, molekularnih in analitskih metod ter njihovem povezovanju v integrirano multi-omsko analizo. Namen dela je predstaviti prednosti, omejitve in uporabnost posameznih metod pri določanju taksonomske sestave, funkcionalnega potenciala in dejanske aktivnosti mikrobnih združb. Pregledane so klasične gojitvene metode, molekularni pristopi, kot so PCR, qPCR, Sangerjevo in NGS sekvenciranje, vključno z 16S rRNK amplikonskim in shotgun metagenomskim sekvenciranjem, ter napredne tehnologije sekvenciranja z dolgimi odčitki. Poseben poudarek je namenjen indirektnim analitskim metodam, predvsem metabolomiki in metaproteomiki, ki omogočajo vpogled v presnovne poti in izražene beljakovine mikrobioma. Delo izpostavlja, da posamezne metode same po sebi ne zagotavljajo celostnega razumevanja mikrobioma, saj so omejene z relativno kvantifikacijo, pristranskostmi in nezmožnostjo razlikovanja med aktivnimi in neaktivnimi mikrobi. Ključna ugotovitev je, da integracija metagenomskih, transkriptomskih, proteomskih in metabolomskih podatkov omogoča natančnejšo interpretacijo mikrobne strukture, funkcije in interakcij z gostiteljem ter predstavlja najučinkovitejši pristop za raziskovanje vloge mikrobioma v zdravju in bolezni.20262026-06-26 07:16:07Diplomsko delo/naloga184081sl