<?xml version="1.0"?>
<rdf:RDF xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#" xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/"><rdf:Description rdf:about="https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=181375"><dc:title>Primerjava genotipov bakterije Escherichia coli z betalaktamazami z razširjenim spektrom delovanja iz človeških in okoljskih vzorcev</dc:title><dc:creator>Marič,	Leon	(Avtor)
	</dc:creator><dc:creator>Janežič,	Sandra	(Avtor)
	</dc:creator><dc:creator>Rupnik,	Maja	(Avtor)
	</dc:creator><dc:subject>E. coli</dc:subject><dc:subject>odpornost proti antibiotikom</dc:subject><dc:subject>Eno zdravje</dc:subject><dc:subject>okolje</dc:subject><dc:subject>epidemiologija</dc:subject><dc:description>Bakterija Escherichia coli z encimi β-laktamaze z razširjenim spektrom delovanja (ESBL) je ena izmed glavnih prioritet pri spremljanju proti antibiotikom odpornih bakterij. Njena prisotnost je dobro raziskana v človeškem in živalskem rezervoarju, medtem ko je v okoljskem rezervoarju manj. Namen naše raziskave je bil primerjati genotipe ESBL-producentnih E. coli iz človeških in okoljskih virov v Sloveniji ter oceniti njihovo genetsko sorodnost. Med junijem 2023 in majem 2024 smo zbrali 561 človeških in 564 okoljskih izolatov iz treh slovenskih regij. Okoljske vzorce smo pridobili iz vode in sedimenta različnih vodnih virov, vključno z rekami, pritoki, jezeri, gramoznicami ter vtoki čistilnih naprav. S sekvenciranjem celotnih genomov smo izvedli multilokusno sekvenčno tipizacijo (MLST) in tipizacijo na osnovi jedrnega genoma (cgMLST), določili gene ESBL ter analizirali prisotnost plazmidov. Skupno smo identificirali 196 sekvenčnih tipov. Okoljski izolati so izkazovali večjo genetsko raznolikost kot človeški, pri katerih je zelo prevladoval sekvenčni tip ST131 (45 %). Med obema rezervoarjema smo našli 48 skupnih sekvenčnih tipov, kar predstavlja 77 % vseh izolatov. Določili smo tudi več klonalnih skupin, ki so vključevale izolate iz obeh rezervoarjev. Med ESBL geni je v obeh rezervoarjih prevladoval gen blaCTX-M-15. Večjo raznolikost plazmidov smo zaznali pri okoljskih izolatih. Hkrati smo identificirali ESBL-kodirajoče plazmide z enakimi replikonskimi tipi tako v človeškem kot okoljskem rezervoarju. Rezultati kažejo na pomembno genetsko povezanost med človeškim in okoljskim rezervoarjem ter poudarjajo pomen vključevanja okoljskega nadzora v strategije spremljanja bakterij, odpornih proti antibiotikom.</dc:description><dc:date>2026</dc:date><dc:date>2026-04-03 09:43:17</dc:date><dc:type>Neznano</dc:type><dc:identifier>181375</dc:identifier><dc:language>sl</dc:language><dc:coverage>Slovenija: Prekmurje, Podravje in Gorenjska</dc:coverage><dc:coverage>Od junija 2023 do maja 2024</dc:coverage></rdf:Description></rdf:RDF>