Vpliv sorodnosti med bakterijami rodu Bacillus na izmenjavo DNAGuček, Žan (Avtor) Štefanič, Polonca (Mentor) Bacillus subtilisodpornost proti rifampicinugen rpoBfrekvenca prenosa DNAsorodnostBacillus subtilis je naravno kompetentna bakterija, ki je sposobna prevzemati zunajcelično DNA iz okolja ter jo integrirati v lasten kromosom. Učinkovitost tega procesa je močno odvisna od stopnje genetske sorodnosti med donorsko DNA in genomom recipienta ter se z njenim zmanjševanjem izrazito zmanjšuje. Poleg tega je B. subtilis sposoben sorodstvenega razlikovanja med genetsko sorodnimi in manj sorodnimi sevi ter z njimi vzpostavlja različne tipe interakcij. To je med drugim razvidno ob stiku dveh rojev, kjer se med manj sorodnimi sevi zaradi antagonističnih odnosov oblikujejo jasno izražene meje. Namen magistrske naloge je bil raziskati vpliv sorodstvenega razlikovanja na prenos DNA med genetsko sorodnimi in manj sorodnimi sevi ter med različnimi vrstami rodu Bacillus v tekočem in na poltrdnem gojišču. Predvidevali smo, da se bo učinkovitost prenosa in vgraditve DNA zmanjševala z upadanjem genetske podobnosti med donorskim in recipientskim sevom. V ta namen smo pripravili 43 mutantnih sevov rodu Bacillus odpornih proti rifampicinu, ki so služili kot donorski sevi za prenos DNA v recipientski sev B. subtilis PS-216. V okviru naloge smo vpeljali in optimizirali metodo za izolacijo mutant odpornih proti rifampicinu ter identificirali točkovne mutacije v genu rpoB. Ugotovili smo, da v tekočem gojišču prihaja do spontanih mutant na rifampicin, zato vpliva sorodnosti DNA na transformacijo recipientskega seva nismo mogli uspešno določiti. Preverjali smo tudi prenos DNA na poltrdnem gojišču in pokazali trend upadanja frekvence prenosa DNA z manjšanjem stopnje sorodnosti med donorskim in recipientskim sevom. Ugotovili smo, da je vgraditev še mogoča pri 84,90 % podobnosti na podlagi primerjave zaporedja gena rpoB med recipientskim in donorskim sevom. Z nalogo smo nakazali, da genetska sorodnost vpliva na frekvenco prenosa in vgraditve DNA med donorskim in recipientskim sevom ter s tem poglobili vpogled v pretok genov med različnimi sevi in vrstami rodu Bacillus.[Ž. Guček]20262026-03-19 07:15:17Magistrsko delo/naloga180885sl