Validacija hkratnega PCR v realnem času za dokaz toksigenosti bakterije Klebsiella oxytoca v čistih kulturah in kužninahDmitrovikj Stefanovska, Tamara (Avtor) Pirš, Mateja (Mentor) Strašek Smrdel, Katja (Komentor) Maver Vodičar, Polona (Recenzent) Klebsiella oxytocadriska povezana z antibiotikiverižna reakcija s polimerazo v realnem časuz antibiotičnim zdravljenjem povezan hemoragični kolitisDriska je pogosta prebavna motnja, ki se kaže s pogostim odvajanjem tekočega blata (vsaj trikrat dnevno) in spremljajočimi simptomi, kot so trebušni krči, napihnjenost in slabost. Posebej pomembna je driska, povezana z antibiotiki (DPA), ki se pojavi pri 5–35 % bolnikov na antibiotični terapiji. Med pomembnejšimi povzročitelji je Klebsiella oxytoca, ki lahko ob prekomerni razrasti proizvaja toksina tilivalin in tilimicin. Ta lahko povzročita hud z antibiotičnim zdravljenjem povezan hemoragični kolitis (angl. antibiotic-associated hemorrhagic colitis AAHC) – vnetje debelega črevesa s krvavo drisko, zlasti ob zdravljenju z β-laktamskimi antibiotiki, kot je penicilin. K. oxytoca je sicer lahko normalno prisotna v črevesju, a lahko postane problematična ob porušenju ravnovesja mikrobiote zaradi antibiotikov. V raziskavi smo uporabili metodo hkratnega PCR v realnem času z namenom ugotavljanja toksigenosti bakterije K. oxytoca v čistih kulturah in kužninah. Pridobljeni rezultati kažejo, da se je molekularna metoda dobro izkazala za hitro in natančno detekcijo bakterije K. oxytoca in določanje njene toksigenosti s pomočjo hkratne detekcije vseh treh ključnih virulenčnih genov AAHC: pehX, npsA, npsB. V okviru magistrske naloge smo analizirali 208 vzorcev, med katerimi smo bakterijo K. oxytoca zaznali v 150 primerih, kar predstavlja 72,12 % vseh testiranih vzorcev. Analiza je pokazala, da je bila toksigena K. oxytoca, povzročiteljica hemoragičnega kolitisa, prisotna v 91 primerih, kar predstavlja 60,67 % vseh pozitivnih vzorcev. Netoksigeni sev bakterije smo zaznali v 59 primerih, kar predstavlja 39,33 %.[T. Dmitrovikj Stefanovska]20252025-10-15 07:15:08Magistrsko delo/naloga175074sl