Analiza lokalnih genskih virov tatarske ajde z mikrosatelitnimi označevalciAlberti, Taj (Avtor) Luthar, Zlata (Mentor) Jeseničnik, Taja (Komentor) tatarska ajdalokalni genski viriDNAlokusalelmikrosatelitni označevalcigenotipizacijadendrogramfaktorialna analizaV diplomski nalogi smo se osredotočili na genotipizacijo tatarske ajde (Fagopyrum tataricum Gaertn.), pri čemer smo analizirali 14 različnih genskih virov. Od teh je bilo 7 lokalnih in 7 tujih, ki se jih hrani v genski banki Biotehniške fakultete Univerze v Ljubljani. S postopkom izolacije smo iz listov pridobili kakovostno DNA, ki smo jo z 8 mikrosatelitnimi označevalci vključili v verižno reakcijo s polimerazo. Za preverjanje in vizualizacijo namnoženih fragmentov DNA smo uporabili agarozno gelsko elektroforezo, ki omogoča analizo prisotnosti in velikosti fragmentov, uspešno se je pomnožilo vseh 8 lokusov. Nato smo s kapilarno elektroforezo pridobili podatke, ki smo jih obdelali s programom GeneMapper 6. Parametre genetske variabilnosti smo izračunali s programom Cervus. Uspešno se je pomnožilo 20 različnih alelov, v povprečju 2,5 alela na lokus. Povprečna informacijska vrednost polimorfizma (PIC) je bila 0,341. Najkrajši alel je imel dolžino 141 bp, najdaljši pa 267 bp. Povprečna dejanska heterozigotnost (Ho) je bila 0,5, povprečna pričakovana heterozigotnost (He) pa 0,4. Trije SSR označevalci od 8 so bili monomorfni, kar nakazuje na visoko homozigotnost pri proučevanih genotipih. Zelo dobro razmejeno skupino, ki jo potrjuje visoka statistična podpora (bootstrap), so tvorili 4 genotipi: 122, B, 105 in 132.20252025-09-12 07:19:24Diplomsko delo/naloga172933sl