Napovedovanje optičnih lastnosti fluorescenčnih molekul za detekcijo fibril amiloida b s strojnim učenjemStražišar, Luka (Avtor) Pesek, Matevž (Mentor) Kladnik, Jerneja (Komentor) strojno učenjeamiloid βfluorescenčne molekulske sondeoptične lastnostilinearna regresijanaključni gozdFluorescenčne molekulske sonde z emisijo v bližnjem infrardečem področju predstavljajo obetavno diagnostično metodo za detekcijo agregatov amiloida b, biomarkerjev, značilnih za Alzheimerjevo bolezen. Ker so priprava kot tudi meritve optičnih lastnosti takih molekul zamudne in drage, bi bilo zato učinkovito, če bi na podlagi strukture molekule znali napovedati, kakšne bi bile optične lastnosti teh spojin v stiku z agregati amiloida b, s čimer bi zmanjšali število nepotrebnih sintez in karakterizacij molekul. V diplomski nalogi smo se tako osredotočili na napovedovanje treh optičnih lastnosti, in sicer: i) absorpcijskega maksimuma, ii) emisijskega maksimuma ter iii) amplifikacije fluorescence ob vezavi izbrane fluorescenčne molekule na fibrile amiloida b. Pri tem smo uporabili različne numerične predstavitve molekul in metode strojnega učenja. Ugotovili smo, da valovne dolžine absorpcijskih in emisijskih maksimumov negativno korelirajo s kemijsko trdoto. Z analizo pomembnosti značilk pri napovedovanju amplifikacije z naključnim gozdom smo identificirali podstrukturo s povprečno visoko aktivnostjo.20252025-09-08 14:20:12Diplomsko delo/naloga172557sl