<?xml version="1.0"?>
<rdf:RDF xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#" xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/"><rdf:Description rdf:about="https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=172555"><dc:title>Načrtovanje in sestavljanje sintezne knjižnice nanoteles proti β-laktamazi BcII na osnovi ogrodja cAbBCII10</dc:title><dc:creator>Krajnik,	Bor	(Avtor)
	</dc:creator><dc:creator>Petrovič,	Uroš	(Mentor)
	</dc:creator><dc:subject>nanotelo</dc:subject><dc:subject>načrtovanje proteinov</dc:subject><dc:subject>dvohibridni sistem kvasovke</dc:subject><dc:description>Nanotelesa so enodomenski fragmenti kamelidnih težkoverižnih protiteles. Zaradi svoje velikosti imajo nanotelesa več prednosti pred klasičnimi protitelesi, zato jih uporabljamo na različnih področjih raziskovanja in medicine. Običajno nanotelesa pridobivamo z imunizacijo kamelidov, kar je zamuden in drag postopek. Obstaja tudi več alternativnih metod pridobivanja nanoteles brez imunizacije živali, med katerimi se v zadnjem času vedno bolj uveljavlja načrtovanje nanoteles z uporabo strojnega učenja.
V magistrski nalogi smo načrtovali nova nanotelesa proti β-laktamazi BcII iz bakterije Bacillus cereus na osnovi ogrodja cAbBCII10. Za ta namen smo z orodjem AlphaFold 3 napovedali strukturo kompleksa cAbBCII10 in BcII, nato pa smo z metodami strojnega učenja napovedali nova nanotelesa, ki se vežejo na isti epitop kot cAbBCII10. Na podlagi zaporedij načrtovanih nanoteles smo pripravili knjižnico zaporedij, ki smo jo sestavili s cikličnim sestavljanjem s polimerazo. Nato smo z dvohibridnim sistemom kvasovke preverili vezavo načrtovanih nanoteles na BcII in preverili kvaliteto sestavljene knjižnice z metodami sekvenciranja naslednje generacije. Zaradi napak, ki so nastale pri sestavljanju knjižnice, nismo uspeli preveriti interakcije vseh načrtovanih nanoteles z BcII, kljub temu pa smo izolirali tri nova nanotelesa z nizko afiniteto do β-laktamaze BcII</dc:description><dc:date>2025</dc:date><dc:date>2025-09-08 14:20:00</dc:date><dc:type>Magistrsko delo/naloga</dc:type><dc:identifier>172555</dc:identifier><dc:language>sl</dc:language></rdf:Description></rdf:RDF>