Fenotipska in genotipska karakterizacija mikrobne odpornosti ter filmotvornosti izbranih po Gramu pozitivnih in negativnih bakterijPungartnik, Anja (Avtor) Klančnik, Anja (Mentor) Hrast Rambaher, Martina (Komentor) Listeria monocytogenesListeria innocuaStaphylococcus aureusPseudomonas aeruginosaEnterobacter cloacaeodpornost proti antibiotikombiofilmfenotipska karakterizacijagenotipska karakterizacijaprotibiofilmske spojineOdpornost bakterij proti antibiotikom ter filmotvornost predstavljata velik problem v živilski verigi in medicini. Za postavitev strategij nadzora in obvladovanje okužb, povezanih z odpornostjo in filmotvornostjo bakterij, je pomembno poznavanje potencialno tarčnih mehanizmov na fenotipskem in genotipskem nivoju. V magistrskem delu smo fenotipsko in genotipsko okarakterizirali odpornost ter filmotvornost po Gramu pozitivnih bakterij (L. monocytogenes ATCC 19115, L. innocua ŽM 39, S. aureus ATCC 25923) in po Gramu negativnih bakterij (P. aeruginosa ATCC 15442, P. aeruginosa ATCC 27853 in E. cloacae ŽMJ 88). Na fenotipskem nivoju smo antibiotikom eritromicin, vankomicin, kanamicin, ciprofloksacin, ampicilin in tetraciklin določili vrednosti minimalne inhibitorne koncentracije z metodo mikrodilucije in barvilom resazurin. Filmotvornost smo vrednotili z barvanjem biomase biofilma z barvilom kristal vijoličnim. Za določanje odpornost in filmotvornost na genotipskem nivoju, smo pridobili sekvence celotnega genoma izbranih bakterij in jih analizirali z uporabo bioinformacijskih orodij. Fenotipska karakterizacija mikrobne odpornosti proti antibiotikom je pokazala heterogeno odpornost izbranih bakterij. Na podlagi fenotipske karakterizacije filmotvonosti smo kot najbolj filmotvorne določili bakterije L. monocytogenes ATCC 19115 in S. aureus ATCC 25923. Na bakterijah S. aureus ATCC 25923 smo med 862 aktivnimi spojinami knjižnice Fakultete za farmacijo določili 69 spojin s protibiofilmskim delovanje, in izpostavili spojine 6C3, 6B3 in 6B4, ki oponašajo D-alanin ter spojini 10C8 in 10D8, ki spadata med cianotiofenske zaviralce encima MurF. Genotipska karakterizacija je na podlagi genov aph(3′)-IIb in blaCMH 3, omogočila izpostavitev dveh molekulskih mehanizmov odpornosti proti antibiotikom in sicer encim aminoglikozid‑fosfotransferazo, mehanizem odpornosti proti kanamicinu, ter encim β‑laktamazo, mehanizem odpornosti proti ampicilinu.20252025-09-05 07:16:23Magistrsko delo/naloga171972sl