Lastnosti vode v bližini ravnih stenFlajšar, Nejc (Avtor) Urbič, Tomaž (Mentor) fazne mejegladka stenahidrofobne interakcijehidrofilne interakcijeVoda ob faznih mejah spremeni svoje obnašanje in tudi vpliv na topljence. V tem magistrskem delu sem ob modelni gladki steni preučeval spremembo gostotnih profilov, preferenčne orientacije in dielektričnost vode ter spremembe interakcij, induciranih s topilom. V ta namen sem uporabil lasten program za simulacijo molekulske dinamike ob modelni steni. S primerjavo izračunanih lastnosti vode z obstoječimi podatki sem ugotovil, da uporabljena modelna gladka stena, ustreza nekaterim realnim faznim mejam, kot so npr. diamantna površina. Pokazal sem tudi, da lahko stena močno vpliva na interakcije, inducirane s topilom. Z rezultati simulacij pokažem, kako stena vpliva na strukturo vode okoli topljencev, in to strukturo povežem s potencialnimi krivuljami interakcij. Te interakcije, ki se delijo na hidrofobne in hidrofilne, se pogosto uporabljajo kot modelna razlaga sil, ki vodijo zvijanje proteinov. Z rezultati simulacij pokažem, da je prisotnost sten pomembna pri takšni uporabi in predstavim interpretacijo rezultatov pri razlagi denaturacije proteinov.20252025-09-02 13:30:01Magistrsko delo/naloga171783sl