Sinteza derivatov zaviralca CDK1 in vrednotenje primernosti za vgradnjo v heterobifunkcionalne molekuleBobnar, Sara (Avtor) Sosič, Izidor (Mentor) CDK1rakRO-3306himerni razgrajevalciCDK1, od ciklina odvisna kinaza 1, je pomemben regulator pri uravnavanju celičnega cikla. V kompleksu s ciklinom B ima ključno vlogo pri prehodu celic iz G2 faze v M fazo in pri napredovanju M faze celičnega cikla. Aktivnost CDK1 je pogosto prekomerno izražena pri rakavih celicah, kar je povezano z nenadzorovano proliferacijo in z razvojem rakavih obolenj, kot so na primer rak dojke, rak pljuč, trebušne slinavke in jajčnikov. Tako predstavlja pomembno in obetavno tarčo pri razvoju novih terapij za zdravljenje raka. Med znanimi zaviralci CDK1 velja izpostaviti molekulo RO-3306, ki zaradi visoke selektivnosti predstavlja dobro osnovo za nadaljnje kemijske modifikacije. Tarčna razgradnja proteinov je postala obetavna metoda z izrazitim terapevtskim potencialom. Himerni razgrajevalci imajo v primerjavi s klasičnimi zaviralci več prednosti, in sicer boljšo učinkovitost, zmanjšano toksičnost in izboljšano selektivnost. V sklopu magistrske naloge smo se osredotočili na raziskovanje derivatov RO-3306, ki bi lahko bili primerni za vgradnjo v heterobifunkcionalne molekule PROTAC, ki bi delovale na CDK1. Ker kristalna struktura kompleksa CDK1 z RO-3306 ni poznana, je potrebno mesto modifikacije na zaviralcu, kamor lahko pripnemo distančnik brez negativnega vpliva na vezavo v aktivno mesto, ugotoviti z alternativnimi pristopi. Tako smo na podlagi usmerjene sinteze več različnih derivatov in njihovega encimskega vrednotenja ugotovili, pri katerih molekulah se po modifikaciji strukture afiniteta do CDK1 ohrani. V sklopu magistrske naloge smo sintetizirali pet derivatov RO-3306, ki so se razlikovali v strukturi in načinu pripenjanja distančnika. Tako smo ugotovili, kako struktura distančnika oziroma funkcionalne skupine, vezane na določeno mesto na zaviralcu, vplivajo na zaviranje kinazne aktivnosti CDK1. Zaviralna aktivnost končnih spojin je bila določena z biokemijskim vrednotenjem, in sicer s komercialno dostopnim encimskim testom. Med končnimi spojinami smo dobili različne rezultate in ugotovili, da nekatere spremembe v strukturi pomenijo popolno izgubo zaviralne aktivnosti CDK1, z določenimi pa lahko pripravimo analoge RO-3306, ki delno ohranijo zaviralno aktivnost in so tako primerni za vgradnjo v molekule PROTAC.20252025-07-02 13:18:09Magistrsko delo/naloga170132sl