Konkurenčnost bakterijskih sevov iz rodov Bacteroides in Prevotella v kokulturah pri različnih gojitvenih pogojihKozoderc, Nina (Avtor) Accetto, Tomaž (Mentor) črevesna mikrobiotaPrevotellaBacteroidesmonokulturakokulturasekvenciranje NGSrazgradnja ksilanarazgradnja proteinskih hidrolizatovV magistrskem delu smo preučevali konkurenčnosti serijskih kokultur več vrst iz rodov Bacteroides in Prevotella pri različnih gojitvenih pogojih. Namen je bil ugotoviti, kateri sevi so bolj konkurenčni pri različnih koncentracijah ksilana in proteinskih hidrolizatov ter ali med izbranimi vrstami obstajajo antagonistične interakcije. Uporabili smo klasične metode striktno anaerobnega dela v kombinaciji z molekularnimi pristopi, kot so sekvenciranje NGS in analiza pridobljenih odčitkov zaporedij gena 16S rRNA. Rezultati so pokazali, da je hitrost rasti posameznih sevov v monokulturah le delno napovedovala prevlado v kokulturah. Poleg tega med izbranimi sevi nismo dokazali antagonizma, zato sklepamo, da je konkurenčnost izbranih sevov odvisna od stopnje učinkovitosti mehanizmov za prevzem in razgradnjo ksilana kot tudi od pretvorbe alternativnih virov ogljika (proteinskih hidrolizatov). V monokulturah so izbrani sevi iz rodu Prevotella, kljub počasni rasti, dosegali višje vrednosti OD600 in tudi prevladali v vseh preizkušenih kokulturah, ne glede na spremembe v količini ksilana, proteinskih hidrolizatov ali vrednosti pH. Na osnovi tega sklepamo, da njihova konkurenčnost temelji tako na učinkovitejših metabolnih mehanizmih kot tudi na boljši prilagodljivosti na spremembe v okolju.[N. Kozoderc]20252025-03-21 07:15:45Magistrsko delo/naloga167951sl