Povezava med dovzetnostjo za razvoj raka želodca in variacijami v genih za popravilo DNARepa, Katarina (Avtor) Hudler, Petra (Mentor) rak želodcageni za popravilo DNAXRCC1ERCC1SNPrs1799782rs25487rs3212986rs11615Rak želodca je v svetovnem merilu tretji vodilni vzrok smrti zaradi raka. Kljub upadu incidence in smrtnosti v zadnjih desetletjih breme bolezni ostaja visoko in naj bi se v prihodnosti zaradi staranja populacije še zvišalo. Rak želodca je molekularno in fenotipsko izjemno heterogena bolezen, ki se pogosto diagnosticira šele v napredovalni fazi, ko je zdravljenje oteženo. Ena od možnih razlag za razlike v odzivu bolnikov na zdravljenje bi bili lahko polimorfizmi posameznega nukleotida (SNP) v genih za popravilo DNA. Geni, kot sta XRCC1 in ERCC1, sodelujejo v različnih mehanizmih popravila poškodb v DNA, ki jih med drugimi ustvarijo kemoterapevtska zdravila na osnovi platine, in so zato lahko povezani z učinkovitostjo zdravljenja. V magistrski nalogi smo na podlagi analize z bioinformacijskimi orodji izbrali kandidatne SNP-je rs1799782 in rs25487 v XRCC1 ter rs3212986 in rs11615 v ERCC1 in na vzorcih DNA bolnikov z rakom želodca iz slovenske populacije izvedli genotipizacijo s tehniko kompetitivne alelno specifične verižne reakcije s polimerazo. Nato smo s statističnimi analizami ovrednotili povezave med kandidatnimi SNP-ji in tveganjem za nastanek bolezni, kliničnimi kazalci in preživetjem bolnikov. Ugotovili smo, da je rs3212986 povezan z višjo dovzetnostjo za razvoj raka želodca. SNP-ji rs25487, rs3212986 in rs11615 so statistično značilno povezani z nekaterimi kliničnimi kazalci, kot so stopnja diferenciacije, histološki tip tumorja po Laurenu ter vaskularna invazija. Odkrili smo tudi, da so rs1799782, tip tumorja po Laurenu ter perinevralna invazija povezani s preživetjem bolnikov z rakom želodca. Razširitev naše študije bi lahko pomagala zdravnikom pri sprejemanju odločitev o zdravljenju te kompleksne bolezni.20242024-10-17 07:15:32Magistrsko delo/naloga164115sl