Identifikacija gliv, ki bi lahko povzročale zgodnje odpadanje plodov oljke, na osnovi črtne kode DNAPremrl, Petja (Avtor) Dolinar, Marko (Mentor) Tavčar Verdev, Petra (Komentor) oljkaidentifikacija glivčrtna koda DNAregija ITSV oljkarstvu severnega Sredozemlja se v zadnjih letih pojavlja problem odpadanja plodov oljk v zgodnji fazi razvoja. Plodovi potemnijo, se posušijo in odpadejo, kar lahko pridelek zmanjša za več kot polovico. Razlog za ta pojav še ni znan. Različni viri kot vzrok navajajo abiotske dejavnike, kot sta suša in temperaturna nihanja, spet drugi pa navajajo prisotnost patogenih gliv ali škodljivih insektov. Cilj diplomskega dela je bil z uporabo črtne kode DNA identificirati vrste gliv, ki so prisotne na okuženih plodovih oljk in bi lahko povzročile njihovo zgodnje odpadanje. Izolirali smo genomsko DNA in z verižno reakcijo s polimerazo (PCR) pomnožili dele genoma, ki predstavljajo vmesnik – regijo ITS – med zapisoma za ribosomsko RNA 18 S in 28 S. Regija ITS velja za najprimernejše variabilno zaporedje v genomu gliv, ki omogoča določitev organizma do vrste natančno. Dobljenim produktom PCR smo določili nukleotidno zaporedje. S primerjavo teh zaporedij z zaporedji iz zbirk GenBank in BOLD smo identificirali več rodov gliv, med katerimi najdemo tudi znane patogene glive, ki okužujejo oljke. Najpogosteje identificirani rodovi gliv so bili Alternaria, Aureobasidium, Cladosporium, Neofusicoccum in Trichoderma. Določanje gliv do vrste natančno se je izkazalo za problematično, saj smo pri analizi posameznih zaporedij v zbirkah pogosto naleteli na več zadetkov z visoko podobnostjo, ki so pripadali različnim vrstam istega rodu. Mnogi rodovi vsebujejo poleg patogenih tudi endofitne glive, kot sta Alternaria alternata in Aureobasidium pullulans, ki lahko pod določenimi pogoji (npr. ob temperaturnem nihanju) postanejo patogene za oljke. Naši rezultati kažejo, da je prezgodnje odpadanje plodov oljk najverjetneje posledica okužbe z eno ali več glivami, katerih zaporedja smo našli v vzorcih okuženih plodov oljke. Možno pa je tudi, da so za okužbo krivi abiotski dejavniki, ki vplivajo na nekatere endofitne glive, da postanejo patogene.20242024-09-06 13:30:00Diplomsko delo/naloga161072sl