Ugotavljanje pojavnosti virusa Sindbis v SlovenijiPozvek, Patricija (Avtor) Korva, Miša (Mentor) arbovirusivirus Sindbiskomarjigenotip IVNGSfilogenetska sorodnostArbovirusi so virusi, ki v naravi krožijo med členonožnimi prenašalci, komarji, klopi in peščenimi muhami, in naravnimi gostitelji kot so ptice in mali sesalci. Ljudje se okužijo z arbovirusi ob vbodu okuženega prenašalca, kadar je gostota prenašalcev in gostiteljev v okolju zelo visoka. Med medicinsko pomembne arboviruse sodi tudi virus Sindbis (SINV), ki pri ljudeh povzroča mrzlico z izpuščaji in bolečinami v sklepih. SINV so v komarjih in pticah dokazali v številnih evropskih državah, bolezen pri ljudeh pa je pogostejša na Finskem in Švedskem. Z magistrsko nalogo smo želeli ugotoviti ali SINV kroži tudi med komarji v Sloveniji, katere vrste komarjev so vpletene v enzoonotski krog virusa in kateri genotip SINV prenašajo. Pregledali smo 97.859 komarjev, ki smo jih vzorčili med leti 2017 in 2023 na 226 lokacijah po vsej Sloveniji. Ujete komarje smo morfološko identificirali do vrste, ter združili v 10.997 skupin glede na lokacijo, datum vzorčenja, vrsto in spol. Iz vsake skupine komarjev smo osamili NK in z molekularnimi metodami ugotavljali prisotnost virusne RNA. RNA SINV smo dokazali v dveh skupinah komarjev vrste Culex modestus, ki smo jih ujeli avgusta 2022 ob Ledavskem jezeru na Goričkem. Ugotovili smo, da je minimalna stopnja okužbe v komarjih znašala 0,09. Glede na nukleotidno zaporedje gena za nestrukturno beljakovino 4, se SINV-SLO uvršča v genotip IV, ki so ga opisali v Rusiji, Azerbajdžanu in na Kitajskem. Na podlagi poravnav med različnimi izolati SINV-IV smo načrtovali amplikone v velikosti 400 bp, s katerimi smo uspešno pomnožili celoten genom SINV-SLO in tako prvič opredelili SINV v Sloveniji.[P. Pozvek]20242024-08-24 07:15:26Magistrsko delo/naloga160256sl