Zaviranje homodimerizacije proteaze Mpro in bakterijske histidin kinaze EnvZ z malomolekulskimi inhibitorji v bakteriji Escherichia coliStarc, Gaja (Avtor) Novinec, Marko (Mentor) homodimerizacijamalomolekulski inhibitor dimerizacijeproteaza Mprobakterijska histidin kinaza EnvZHomodimerizacija proteinov je ključna za uravnavanje številnih procesov v celicah. Encimi morajo za katalitično aktivnost pogosto dimerizirati, na ta način je torej opravljanje morfološke funkcije uravnavano z oligomernim stanjem. S porastom pojava odpornosti na antibiotike in pojavom novih virusov, se vse več raziskav ukvarja tudi s preučevanjem dimerizacijske površine kot potencialne tarče v razvoju novih zdravil, Iskanje novih inhibitorjev dimerizacije pa terja učinkovite metode presejanja knjižnic malih molekul, ki omogočajo identifikacijo oligomernega stanja. Tekom diplomskega dela smo skušali preveriti uporabnost sistemov LEXGFP in TOXGFP za detekcijo homodimerizacije v bakteriji Escherichia coli pri presejanju knjižnic malomolekulskih inhibitorjev dimerizacije v celicah. Analizirali smo oligomerno stanje štirih ključnih bakterijskih oz. virusnih encimov, za katere so poznani inhibitorji dimerizacije – proteaze Mpro iz SARS-CoV-2, bakterijske histidin kinaze EnvZ iz E. coli, proteaze citomegalovirusa in proteaze herpes virusa povezanega s Kaposijevim sarkomom. V bakteriji Escherichia coli smo uspeli potrdili le homodimerizacijo prvih dveh, nato pa smo njuno oligomerno stanje analizirali še po uporabi malomolekulskih inhibitorjev homodimerizacije. Statistično značilne rezultate smo uspeli pridobiti le s sistemom TOXGFP, za potrditev uporabnosti tega sistema pri presejanju knjižnic inhibitorjev dimerizacije pa so potrebne dodatne raziskave.20242024-07-02 12:05:01Diplomsko delo/naloga159158sl