Vpeljava različnih metod za obogatitev in detekcijo bakterije Faecalibacterium prausnitziiLešnik, Rebeka (Avtor) Accetto, Tomaž (Mentor) Mahnič, Aleksander (Komentor) črevesna mikrobiotareal-time PCRF. prausnitziirastni pogojibogatitevvampni sokizrabljeno gojiščeFaecalibacterium prausnitzii je Gram-pozitivna, striktno anaerobna, komenzalna bakterija. Predstavlja od 5 do 10 odstotkov skupnega števila bakterij v vzorcih fecesa zdravih ljudi. Zmanjšanje zastopanosti F. prausnitzii povezujemo z različnimi bolezenskimi stanji (Crohnova bolezen, ulcerativni kolitis, kronična vnetna črevesna bolezen). Zaradi proizvodnje butirata, ki ima pomembno presnovno in protivnetno vlogo v črevesju, jo uvršamo med pomembnejše bakterije v človeški črevesni mikrobioti. To daje F. prausnitzii velik potencial za uporabo v probiotikih nove generacije. Magistrska naloga je razdeljena v tri sklope, in sicer optimizacijo molekularne detekcije F. prausnitzii, optimizacijo in vitro gojenja ter analizo vpliva različnih predstavnikov zdrave črevesne mikrobiote na rast F. prausnitzii. V prvem sklopu smo primerjali različne protokole verižne reakcije s polimerazo v realnem času za detekcijo F. prausnitzii. Komercialni komplet RIDA® GENE Faecalibacterium prausnitzii je na podlagi naših ugotovitev zagotavljal najvišjo specifičnost in občutljivost ter ponovljive rezultate. V drugem sklopu magistrskega dela smo uspešno optimizirali in vitro gojenje, ki podpira rast F. prausnitzii. Pokazali smo, da je vampni sok ključni faktor za uspešno gojenje bakterije F. prausnitzii. V tretjem sklopu naloge smo preverili vpliv izrabljenega gojišča izbranih vrst iz rodov Bacteroides in Bifidobacterium na rast bakterije F. prausnitzii. Nasprotno kot pričakovano smo pokazali inhibicijo rasti bakterije F. prausnitzii, ki je bila odvisna od koncentracije dodanega izrabljenega gojišča.[R. Lešnik]20232023-10-01 07:16:44Magistrsko delo/naloga151222sl