Uporaba metode ScanLag za spremljanje rasti bakterijskih kolonijMilošević, Mateja (Avtor) Hadži, San (Mentor) ScanLaghitrost rastispremljanje rasti posameznih kolonijHitrost bakterijske rasti je eden od temeljnih mikrobioloških parametrov. Ocenimo ga lahko z merjenjem optične gostote v različnih časovnih intervalih. Na ta način določimo čas podvojitve za celotno populacijo. Vendar tovrstna analiza na nivoju celotne populacije lahko spregleda pomembno celično heterogenost, kot so na primer razlike v hitrosti rasti posameznih kolonij. Če želimo bolj podrobno razumeti fenotipsko heterogenost ali same procese na ravni posamezne kolonije, potrebujemo metodo, ki bi torej spremljala rast posameznih kolonij. V ta namen smo testirali funkcionalnost metode ScanLag za spremljanje rasti bakterijskih kolonij in raziskali možnosti njene uporabe. V raziskavi smo načrtovali in izvajali poskuse, ki so zajeli različne pogoje rasti. Želeli smo dobiti vpogled v kinetiko rasti posameznih bakterijskih kolonij in ugotoviti omejitve metode in pripadajočega programa za analizo. Metoda temelji na avtomatičnem zajemanju slik bakterijskih kolonij na agaroznih ploščah z uporabo pisarniškega skenerja. Za analizo smo uporabili računalniške programe narejene na platformi MatLab. Analiza je avtomatična in hitra, ScanLag programi pa so brezplačni. Z avtomatično analizo slik smo spremljali širitve posameznih kolonij in tako določili hitrost rasti.20232023-09-06 11:40:00Diplomsko delo/naloga149327sl