Geni za dejavnike virulence in občutljivost za protimikrobne učinkovine sevov bakterije Escherichia coli, izoliranih iz naravnih kopalnih vodaKralj, Veronika Ana (Avtor) Ambrožič Avguštin, Jerneja (Mentor) mikrobiologija vodeokoljski bakterijski seviEscherichia coliodpornost proti protimikrobnim učinkovinamnaravne kopalne vodegeni za dejavnike virulenceV Sloveniji vključuje monitoring naravnih kopalnih voda le kvantifikacijo koliformnih bakterij in enterokokov. Analiza fenotipskih in genotipskih lastnosti je pogosto ključna za ovrednotenje potencialne patogenosti sevov, bremena genov povezanih z odpornostjo proti protimikrobnim učinkovinam v naravnih vodah in za ugotavljanje potencialnega vira onesnaženja. V okviru magistrskega dela smo raziskali prisotnost genov za dejavnike virulence in odpornost proti sedmim protimikrobnim učinkovinam pri sevih vrste E. coli, izoliranih iz vzorcev vode in sedimentov, odvzetih enkrat mesečno na 4 vzorčnih mestih, v obdobju enega leta. Na podlagi rezultatov, dobljenih z metodo ERIC-PCR, smo iz analize izločili sorodne/klonalne izolate, ki smo jih pridobili na isti lokaciji vzorčenja isti dan. V končno analizo je bilo tako vključenih 62 sevov, ki smo jih uvrstili v filogenetske skupine po Clermontu in z metodo PCR preverili prisotnost 27 genov, povezanih z dejavniki virulence. Pri izbranih sevih smo preverili fenotipsko odpornost proti nekaterim protimikrobnim učinkovinam, genotipsko za β-laktamaze iz skupin TEM, SHV, OXA in CTX-M ter plazmidno zapisano odpornost proti fluorokinolonom (PMQR). Naši rezultati nakazujejo, da so sevi E. coli, prisotni v kopalnih vodah, zelo raznoliki, od potencialno patogenih in večkratno odpornih do občutljivih, brez ključnih dejavnikov virulence. Večkratno odporni, CTX-M pozitivni sevi, in sevi z največ genov za dejavnike virulence, so bili izolirani v februarju, aprilu in juniju v vzorcih vode iz Olimpijskega veslaškega centra ter kopališča v Mali Zaki na Blejskem jezeru. Potencialni vir onesnaženja, glede na genotip izolatov, čas izolacije in mesto vzorčenja, je najverjetneje kmetijska dejavnost.[V. A. Kralj]20232023-04-26 07:15:11Magistrsko delo/naloga145602sl