<?xml version="1.0"?>
<rdf:RDF xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#" xmlns:dc="http://purl.org/dc/elements/1.1/"><rdf:Description rdf:about="https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=145087"><dc:title>Določanje proteinov v okolici STAU1 in STAU2 v celicah HEK293</dc:title><dc:creator>Lenarčič,	Katarina	(Avtor)
	</dc:creator><dc:creator>Petrovič,	Uroš	(Mentor)
	</dc:creator><dc:creator>Milek,	Miha	(Komentor)
	</dc:creator><dc:subject>nevrodegenerativne bolezni</dc:subject><dc:subject>protein staufen</dc:subject><dc:subject>interaktor</dc:subject><dc:subject>biotin-ligaza</dc:subject><dc:description>Protein staufen je RNA-vezavni protein, ki skupaj z molekulo RNA tvori ribonukleoproteinske komplekse kot so na primer stresne granule, ki omogočajo preživetje stresnih pogojev. Spremembe RNA-vezavnih proteinov lahko povzročijo številne nevrodegenerativne bolezni, za katere je značilno propadanje nevronov. V naši raziskavi smo z metodo označevanja okolice z biotinom označili proteine, ki interagirajo ali so v bližini proteina staufen. Uporabili smo dve biotin-ligazi: BirA* in TurboID. Ko smo dokazali, da se je fuzijski protein sintetiziral v celicah HEK293 in je bila biotinilacija proteinov uspešna smo izolirane proteine poslali na analizo z masno spektrometrijo. Rezultati so pokazali, da večina proteinov, ki smo jih določili, sodeluje pri vezavi RNA ali pri strukturi ribosoma, kar nekaj proteinov pa se veže z molekulo DNA. Večje razlike med proteini v okolici proteinov staufen 1 in staufen 2 nismo zaznali. Uporaba različnih biotin-ligaz pa nam je dala vpogled v časovno dinamiko interakcij. Pokazali smo, da se protein staufen nahaja v okolici ribosoma in molekule RNA.</dc:description><dc:publisher>[K. Lenarčič]</dc:publisher><dc:date>2023</dc:date><dc:date>2023-04-05 07:15:02</dc:date><dc:type>Magistrsko delo/naloga</dc:type><dc:identifier>145087</dc:identifier><dc:language>sl</dc:language></rdf:Description></rdf:RDF>